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培训新闻

培训新闻

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通知:6月 MS Perl 脚本培训

2019-03-14        

点击下载PDF盖章通知
培训时间:2019年月6月11-13日(周二至周四)

培训地点:苏州创腾科技培训中心(江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室)

► 特邀讲师:

 徐京城讲师,大连理工大学博士毕业,现为上海理工大学材料学院讲师。

 主要从事高分子材料及低维材料光电性质方面的分子动力学和第一性原理计算模拟。

 现已发表SCI论文十余篇,申请MS Script专利一项(已公开)。

 

► 培训主旨:

Materials Studio中除各计算模块外,还有很多功能如远程计算、批量计算、复杂计算流程、自定义分析/输出等无法直接通过图形界面完成,需要用到MS Script来完成。MS Script API基于Perl脚本语言进行Materials Studio的相关操作和计算控制。

本培训班计划结合Perl脚本语言基础与现有MS Script脚本,讲解Perl脚本语言基础、MS Script脚本实例,旨在帮助用户提高对简单计算/分析任务编写相应MS Script脚本的能力,理解复杂MS Script脚本的运算框架及逻辑并进行自定义修改,提高对计算流程和分析任务编程处理的能力。

► 培训内容:

• MS Script简介

(1)MS Script的主要功能、可调用功能及模块

(2)MS Script的本地运行

(3)MS Script应用举例:在超算上提交计算任务、随机取代构建无序结构、交联数值模型的构建、计算扩散系数、计算玻璃化转变温度、应力应变曲线、……。

(4)开始编写自己的第一个MS Script脚本

• Perl、MS Script API基础及应用

(1)Perl基础:变量、数组、打印

(2)Perl基础:子程序、控制结构

(3)Perl基础:正则表达式

(4)MS Script API基础:原子、化学键、分子、片段、坐标、速度、轨迹、表格、调用计算模块

应用:各环节中穿插氢键的分类统计、轨迹文件的逐帧分析、原子编号、小分子自动命名/分组、原子/质心/晶体结构相关信息输出等脚本练习

•  复杂MS Script脚本的练习、运算思路、进阶改写

(1)构建交联(cross-link)树脂聚合物结构模型,拓展至其他类型交联反应。

(2)计算小分子在聚合物体系的扩散系数,用于评估防腐、渗透、扩散、阻隔等领域中扩散介质或分子在体系中的运动能力。

(3)计算(单一或混合)聚合物结构的玻璃化转变温度,用于评价聚合物结构模型的加工性能(玻璃态/高弹态)。

(4)计算应力应变曲线,用于评估材料的力学性能。

(5)计算平均力势(Potential of Mean Force),计算自由能随反应坐标的分布情况,用于评估生物大分子构象变化(展开、翻转等)、分子吸附、脱附、透过膜结构等过程中自由能的变化情况。

• MS Script GUI脚本程序界面

• 总结和答疑。

► 培训对象:

本培训班主要面向有一定的Materials Studio使用基础(主要为分子动力学及量子力学模块)、希望利用MS Script完成批量任务、流程化计算任务、原理清楚但MS界面无法实现的计算或分析任务的老师或同学,也欢迎已具有一定MS Script使用经验的用户交流分享经验。

本课程不要求已有Perl编程基础。

欢迎确定参加培训的老师和同学,提前反馈需要了解的内容或脚本。

 培训形式:

培训过程中在培训讲师讲解时,所有学员能够上机操作。

 课程安排:查看详情

► 网站报名:请点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!

    手机报名:识别以下二维码,手机提交报名

                     


► 培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:0512-67509707(转220)(叶小姐); 021-51821768转233(陈小姐),13916858963

Email:market@neotrident.com

培训网站http://training.neotrident.com/