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培训新闻

Pipeline Pilot

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Pipeline Pilot化学信息学及数据建模

培训主题:Pipeline Pilot化学信息学及数据建模

培训时间:2013年10月24-25日,共两天

培训地点:上海创腾科技培训中心

培训简介:化学信息学是Pipeline Pilot的最早的应用领域之一,Pipeline Pilot在该领域为我们提供了一系列完整解决方案:支持多种多样的化合物分子文件的读入和输出,快速地对化合物..

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课程编号:NT33-LS21
课程时间:10月24-25日,共二天
课程地点:创腾科技培训中心(上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室)
课程主题:Pipeline Pilot化学信息学及数据建模
课程简介:

        化学信息学是Pipeline Pilot的最早的应用领域之一,Pipeline Pilot在该领域为我们提供了一系列完整解决方案:支持多种多样的化合物分子文件的读入和输出,快速地对化合物的进行性质计算、分析和处理等,多种多样的化合物库的构建和分析工具,如相似性和子结构搜索,根据反应或R基团进行枚举化合物库,构效分析等等。


图1 Pipeline Pilot分析化合物的构象关系(左图为protocol图,右图为动态互动显示的结果网页)

        通过与Data Modeling模块中结合,我们可以进一步拓展Pipeline Pilot在化学信息学方面的功能。我们可以很容易地对化合物及普通数据进行聚类分析,构建高效且预测能力强的数学模型,如贝叶斯模型、递归分割模型、主成份分析等。除了良好的预测能力外,这些模型还具备特征重要性分析的能力,可以识别出重要的子结构特征及理化性质,这将对您进一步优化化合物有很大的帮助。


图2 用Pipeline Pilot快速构建贝叶斯模型

         除了自带的Data Modeling模块,Pipeline Pilot还整合了R统计学软件包,该软件在学术界广泛使用。这些被整合的算法都是被精心挑选的公认的优秀算法,能够对数据进行深入细致的分析,创建出内容丰富、清晰直观的分析图表,帮助您做出合理的决策。这些算法已被无缝整合到Pipeline Pilot中,用户可以直接调用这些组件而无需编写R语言脚本,所获得的输出结果还可以再用Pipeline Pilot工作流程中的其它组件作进一步分析。
        需要强调的是,Pipeline Pilot的数据建模组件都是高度集成化的且简单易用,您只要设置几个参数的就能够轻松地构建出想要的模型及对数据进行快速有效的分析和预测。因此您并无需具备太多的统计学知识。
 
 
课程形式:

  • 教学与上机操作同时进行,并有工程师进行现场指导;
  • 每节课都会留出一定的时间进行讨论交流,并进行答疑;
  • 不定期邀请业界知名专家介绍行业研究动态,分享研究经验;
  • 学员交流与答疑,描述应用现状和解决方法。

课程内容:

  • PP化学信息学与数据建模:Pipeline Pilot基础内容培训
  • PP化学信息学与数据建模:PP在化学信息学领域的应用
  • PP化学信息学与数据建模:使用PP快速构建各种数据模型
  • PP化学信息学与数据建模:使用Pipeline Pilot中的R统计分析包
  • 课程结业证书:全部参加学习完本次培训课程后,可获得培训班结业证书
  • 课程资格认证考试:仅限报明参加资格认证考试的培训生

资格认证考试:

  • 本培训课程提供收费的资格认证考试(人民币800元整);
  • 该资格认考试由创腾科技联合国内知名药化企业及学术界的药物化学同行共同举行。考试合格者,将颁发资格认证书。获得资格认证的培训生,将享有优先与联合培养单位签约等权利。详情内容可参考附件1《北京创腾科技有限公司联合培养计划》。

授课及教材编写:

  • 全程授课由生命科学部门技术支持负责;
  • 教学材料包括纸版的PPT材料(含原理讲解及案例分析)和中文操作教程。
  • 培训期间会不定期邀请业内知名人士来培训班担任客座讲师。

面向对象(推荐):
药物设计、化学信息学等方面研究人员。

培训班联系人:
创腾科技有限公司 市场部
电话:021-58353866-242(万小姐),15121060342
                021-58353866-233(陈小姐),13916858963
传真:021- 50158556
Email:market@neotrident.com
Web:www.neotrident.com

 

日期 时间 内容

10月24日                    培训师:谢焕章/邹传新

08:00-09:00 报到和注册
报到地点:上海浦东区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室
09:00-10:00 Pipeline Pilot基本界面
PP基础架构,PP界面介绍,构建简单的protocol,熟悉component分类
10:15-10:30 茶歇
10:30-11:45 Pipeline Pilot基础内容培训
基本数据操作与筛选,PilotScript,Subprotocol的构建,发布Protocols
11:45-13:30 午餐
13:30-14:45 Pipeline Pilot在化学信息学中的应用
Chemistry模块概述,化合物的理化性质计算及结构处理,分子指纹,化学结构搜索
14:45-15:00 茶歇
15:00-16:15 Pipeline Pilot在化学信息学中的应用
组合化合物库的设计,构效关系分析,计算最大公用子结构,生物电子等排体优化,互变异构与光学异构处理
16:15-17:15 课程讨论及答疑

10月25日  

培训师:谢焕章/邹传新

09:00-10:45 基于Data Modeling模块的数据建模
Data Modeling模块的概述,基本统计组件,回归模型,聚类分析,贝叶斯模型
10:45-11:00 茶歇
11:00-11:45 基于Data Modeling模块的数据建模
递归分割模型与决定数模型,Pareto优化,主成分分析,遗传函数逼近
11:45-13:30 午餐
13:30-14:45 利用Pipeline Pilot中的R统计包构建数据模型
R统计模块的配置,基于R的数据绘图,基于R的数据分析
14:45-15:00 茶歇
15:00-16:00 利用Pipeline Pilot中的R统计包构建数据模型
R的各种聚类分析方法,使用R构建数据模型,自定义基于R语言的组件
16:00-17:00 课程资格认证考试及答疑

 

课程费用:

培训费用

1人参加

优惠条件1:同一单位,多人参加同一门课程

优惠条件2:同一学员,一年内多次参加培训中心课程

2人以上

3人以上

第2次

第3次

学术客户

2400/人

2000/人

1800/人

2000/人

1800/人

企业客户

3600/人

3200/人

3000/人

3200/

3000/人

 

 

 

 

 

 

 

注:  需要认证的学员需另付考试认证费,人民币800元。

 

付费方式:
a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)
      户 名:北京创腾科技有限公司上海分公司
      开户行:中国工商银行上海市分行浦东开发区白杨路支行
      账 户:1001154119006907319
b、现金支付:培训现场只收取现金,不接受刷卡。

住宿推荐:
1) 宾馆名称:锦江之星(上海磁悬浮总店)
       宾馆地址:上海浦东新区白杨路260号(浦东新国际博览中心 近龙阳路)
       宾馆电话:021-51099066

2)宾馆名称:锦江之星(新国际博览中心店)
       宾馆地址:上海浦东新区芳华路37号(浦东新国际博览中心 近沪南路)
       宾馆电话:021-68920708

注:以上两个经济型酒店供学员参考。因培训地址离国际博览中心较近,遇到展览旺季,周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。 


交通:乘地铁7号线花木路站下,4号出口,出站即到。