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培训新闻

Discovery Studio

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分子对接

培训主题:分子对接

培训时间:2012年11月22-23日,共两天

培训地点:上海创腾科技培训中心

培训简介:对接程序,包含Libdock、LigandFit、CDOCKER、FlexibleDocking,

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  • 培训费用
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课程编号:NT5-LS3
课程时间:11月22日-23日(周四至周五),共两天
课程地点:创腾科技培训中心(上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室)
课程主题: 分子对接
课程简介:

       分子对接(molecular docking)依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程,模拟小分子配体与受体生物大分子相互作用,预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。配体与受体相互作用是分子识别的过程,主要包括静电作用、氢键作用、疏水作用、范德华作用等。分子对接的种类则主要包括刚性对接、半柔性对接、柔性对接。
       分子对接是基于结构药物设计的核心模拟手段。采用分子对接模拟技术,科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选,药物分子的结构与话与改造,酶与底物相互作用的机理研究等工作,从而大大提高实验效率。
       在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中,共有四种对接程序,包含Libdock、LigandFit、CDOCKER、FlexibleDocking,这四种对接算法各有优势,能够满足广大科研工作者的多种应用需求,为他们提供了配体受体间相互识别的“利器”。本课程将详细介绍这四种对接算法的原理、应用及操作,帮助学员更好地掌握分子对接这一重要的模拟手段。

预备知识:
参加本课程的学习需要对蛋白和小分子有一定的了解。

课程形式:

  • 通过文献案例分析讲解各种分子对接技术的应用方向,以及相应的原理介绍;
  • 上机操作练习:讲解不同分子对接技术的操作流程及参数设置;
  • 发散式教学:剖析技术细节,将分子对接与参训者的实际问题相联系,解决实际问题。
  • 学员交流与答疑,描述应用现状和解决方法。

课程内容:

  • 基于受体的药物设计专题之一:基于“热区”匹配的高通量虚拟筛选模块DS_LibDock
  • 基于受体的药物设计专题之二:基于形状匹配的高通量虚拟筛选模块DS_LigandFit
  • 基于受体的药物设计专题之三:基于格点计算的柔性对接模块DS_CDOCKER
  • 精确的柔性对接模块DS_FlexibleDocking

资格认证考试:

  • 本培训课程提供收费的资格认证考试(人民币800元整);
  • 该资格认考试由创腾科技联合国内知名药化企业及学术界的药物化学同行共同举行。考试合格者,将颁发资格认证书。获得资格认证的培训生,将享有优先与联合培养单位签约等权利。详情内容可参考附件1《北京创腾科技有限公司联合培养计划》。

授课及教材编写:

  • 全程授课由生命科学部门技术支持负责;
  • 教学材料包括纸版的PPT材料(含原理讲解及案例分析)和中文操作教程。
  • 培训期间会不定期邀请业内知名人士来培训班担任客座讲师。

面向对象(推荐):
没有或只有少量模拟经验的药化研究人员。

培训班联系人:
创腾科技有限公司 市场部
电话:021-58353866-242(万小姐),15121060342
                021-58353866-233(陈小姐),13916858963
传真:021- 50158556
Email:market@neotrident.com
Web:www.neotrident.com

 

日期

时间

内容

1122

培训师:方菁

08:00-09:00

报到和注册
报到地点:上海浦东区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室

09:00-10:15

Discovery Studio基本界面

DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与实际操作

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

分子对接理论;分子对接概述

分子对接专题之一:基于热区匹配的高通量虚拟筛选模块DS_LibDock

基本原理介绍及案例分析

11:45-13:30

午餐

13:30-14:45

分子对接专题之一:基于热区匹配的高通量虚拟筛选模块DS_LibDock

参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:15

分子对接专题之二:基于形状匹配的高通量虚拟筛选模块DS_LigandFit

基本原理介绍及案例分析

16:15-17:15

课程讨论及答疑

1123

培训师:方菁

09:00-10:15

分子对接专题之二:基于形状匹配的高通量虚拟筛选模块DS_LigandFit

参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

分子对接专题之三:基于格点计算的柔性对接模块DS_CDOCKER

基本原理介绍、案例分析、参数设置意义、实际操作技巧

11:45-13:30

午餐

13:30-14:45

分子对接专题之三:基于格点计算的柔性对接模块DS_CDOCKER

参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

分子对接专题之四:精确的柔性对接模块DS_FlexibleDocking

基本原理介绍、案例分析

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:15

分子对接专题之四:精确的柔性对接模块DS_FlexibleDocking

参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

基于受体药物设计之分子对接总结

16:15-17:15

课程讨论及答疑

 

课程费用:

 

培训费用

1人参加

优惠条件1:同一单位,多人参加同一门课程

优惠条件2:同一学员,一年内多次参加培训中心课程

2人以上

3人以上

第2次

第3次

学术客户

3600/人

3000/人

2700/人

3000/人

2700/人

企业客户

5400/人

4800/人

4500/人

4800/

4500/人

 

 

 

 

 

 

 

补充优惠:
   
1. 每位参加培训班的学员,如能额外推荐3名人员参加培训,则可获得免费听课券一张。(有效期限一年)可选择一年中任意一节培训班免费参加,当次课程除外。(认证考试, 需另行缴费。)

    2. 本次课程资格认证考试(800元)免费。(推广期6月份之前的培训均享受此项优惠)

付费方式:
 a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)
       户 名:北京创腾科技有限公司上海分公司
       开户行:中国工商银行上海市分行浦东开发区白杨路支行
       账 户:1001154119006907319
b、现金支付:培训现场只收取现金,不接受刷卡。

住宿推荐:
1) 宾馆名称:锦江之星(上海磁悬浮总店)
       宾馆地址:上海浦东新区白杨路260号(浦东新国际博览中心 近龙阳路)
       宾馆电话:021-51099066

2)宾馆名称:锦江之星(新国际博览中心店)
       宾馆地址:上海浦东新区芳华路37号(浦东新国际博览中心 近沪南路)
       宾馆电话:021-68920708

注:以上两个经济型酒店供学员参考。因培训地址离国际博览中心较近,遇到展览旺季,周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。 


交通:乘地铁7号线花木路站下,4号出口,出站即到。