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培训新闻

Discovery Studio

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12月计算机辅助酶的理性设计培训【在线课程】

培训主题:12月计算机辅助酶的理性设计培训【在线课程】

培训时间:2020年12月23-25日(共三天)

培训地点:在线课程

培训简介:(2008-LS)本次培训班旨在帮助学员快速了解并掌握DS中有关酶的理性设计的各模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决。

在线报名 返回课程
  • 培训介绍
  • 课程表
  • 培训费用
  • 住宿交通

* 说明:本次培训为线上培训,请放心报名,课程结束后会开放两周视频回看。

点击下载PDF盖章通知

培训时间:2020年12月23-25日(周三至周五)

培训地点:在线课程
主办方:北京创腾科技有限公司

   学员福利:凡是第三次或以上参加“创腾学院”培训班的学员,都可以在培训现场领取一张当年内有效的半价券!

   注:1、本半价券不可转让,只可本人使用。

          2、半价券可抵现金使用。

 

 

 

 

► 培训主旨:

本次培训班旨在帮助学员快速了解并掌握Discovery Studio中有关酶的理性设计的各模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决,能够将各模拟方法灵活应用到实际的酶领域相关研究课题中,学以致用,解决实际的应用问题。具体包括:

■ 从分子水平分析、预测并优化酶结构

■ 从分子水平预测并解释酶-底物的作用机制

■ 基于理性设计方法改造并优化酶结构

■ 分析可能的突变位点以提高酶的稳定性、同底物的亲和力等

 培训对象:

没有或只有少量模拟研究经验,或刚开始使用Discovery Studio软件、希望进一步系统掌握软件使用技巧、能够快速模拟操作相关课题的酶研究领域人员。

► 培训内容:

本次培训以Discovery Studio软件的基础操作和应用为核心,以酶的理性设计为基础,针对酶的理性设计中所涉及的技术进行介绍,包括:基于酶的一级序列预测翻译后修饰位点和酶的三维结构、酶-底物相互作用预测及优化、通过虚拟氨基酸突变设计同底物亲和力更高的酶或稳定性更高的酶、预测并引入新的二硫键提高酶的稳定性、预测酶结构表面易聚集的位点并进行突变优化、采用分子动力学分析酶的构象变化等等。

本次培训将为参加人员开通MAXFLOW标准版账号,使用时间两个月,参加人员可以通过MAXFLOW标准版使用DS全部教程。MAXFLOW标准版是创腾科技为广大DS用户提供的云端技术服务平台,通过MAXFLOW大家可以享受到以下服务和资源:

支持中心

① 支持社区,用户提出问题,技术专家会及时做出解答

② 问题精析,DS常见的一些使用问题解答

知识中心 

① 操作教程,DS各功能模块使用操作步骤教程

② 视频中心,各功能模块操作视频教程

资源中心

① 文献中心,DS在模拟设计中的文献应用案例

② 新功能精析,DS各版本新功能介绍

► 培训形式:

•  通过文献案例分析讲解酶理性设计策略,以及相应功能模块的原理介绍;

•  讲解酶理性设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置(提供完整的培训教程);

•  学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。

 课程安排:请查看上方课程表”选项

► 网站报名:请点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!

    手机报名:识别以下二维码,手机提交报名

                     

► 创腾学院专属微信公众号:

                      


► 培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:0512-67509707(转220)(叶小姐); 021-51821768转233(陈小姐),13916858963

Email:market@neotrident.com

培训网站http://training.neotrident.com/

日期

时间

内容

第一天

 

08:30-09:00

报到和注册

09:00-10:30

Discovery Studio基本界面

DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与实际操作。

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:45

酶的理性设计概述

酶的理性设计专题之一:酶的序列分析

酶序列的分析,如进化分析、翻译后修饰位点的预测等,应用与操作。

酶的理性设计专题之二:酶结构的构建

同源建模核心原理介绍及案例分析,同源模板的选取技巧、同源模型的优化与评价等。

11:45-12:00

课程讨论及答疑

12:00-14:00

午餐

14:00-15:30

酶的理性设计专题之二:酶结构的构建

同源建模参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

15:30-15:45

茶歇

15:45-16:30

酶的理性设计专题之三:筛选酶的潜在底物(libdock)

分子对接的核心与原理,酶催化位点的定义,酶-底物最终作用模式的选取与分析,关键氨基酸位点的识别与显示方法,libdock基本原理及案例分析。

16:30-17:00

课程讨论及答疑

第二天

 

09:00-10:15

酶的理性设计专题之三:筛选酶的潜在底物(Libdock)

Libdock参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

酶的理性设计专题之四:酶与小分子底物相互作用机理研究(CDOKCER)

CDOCKER基本原理及案例分析,参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

11:45-12:00

课程讨论及答疑

12:00-14:00

午餐

14:00-15:00

酶的理性设计专题之四:酶与小分子底物相互作用机理研究(Flexible Docking)

对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking基本原理介绍、案例分析;参数设置意义、Flexible Docking实际操作技巧及结果分析。

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:30

酶的理性设计专题之四:酶与蛋白底物相互作用机理研究(ZDOCK)

蛋白-蛋白对接,结合位点、结合模式的确定,结合表面关键残基的分析,ZDOCK基本原理介绍、案例分析,参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

16:30-17:00

课程讨论及答疑

第三天

09:00-10:30

酶的理性设计专题之四:酶与底物相互作用机理研究(分子动力学模拟)

MD基本原理,溶剂模型的添加,束缚条件的设定,平衡状态的判定等;

MD参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:30

酶的理性设计专题之四:酶与底物相互作用机理研究(QM/MM)

QMMM基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

11:30-12:00

课程讨论及答疑

12:00-14:00

午餐

14:00-15:15

酶的理性设计专题之五:基于亲和力进行酶设计

突变位点、突变组合的建议,原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

酶的理性设计专题之五:基于热稳定性进行酶设计

突变位点、突变组合的建议,原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

15:15-15:30

茶歇

15:30-16:30

酶的理性设计专题之五:蛋白二硫键的预测与引入

二硫键位点的选取方法,实际操作技巧及结果分析。

酶的理性设计专题之五:基于蛋白聚集效应进行酶设计

建议可能的突变位点降低酶的聚集,基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

16:30-17:00

课程讨论及答疑

 

1人参加

特惠价格及条件(符合任一条件即可):

1、同一单位,≥2人参加 ;

2、同一学员(2011年至今)曾参加过DS培训课程。

3100/人

2500/人

 拼团大促:
◎ 5人拼团价(不限同一单位)2300元/人
◎ 10人拼团价(不限同一单位)2000元/人

 注意事项:

1、由于线上培训需要提前一周邮寄教材,请各位务必在开课前一周完成拼团和汇款工作。
2、所有拼团的人报名时都必须写清楚
几人团,并加上团长的名字,以便于工作人员统计整理。
3、团购活动适用于
2020年8月至12月30日任意DS培训班。

注: 1、培训费包含100元邮寄纸质版教材费用(课程结束后不再提供电子版PPT以及电子版教材)

       2、发票为电子发票,学员缴费后扫码填写发票信息,发票将发送到学员邮箱,发票内容为“培训费”“会议费”

       3、本次培训不提供增值税专用发票,统一开增值税普通发票。

 

  付费方式:

    银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

    户   名:苏州创腾数据科技有限公司 (行号:308305008189)

    开户行:招商银行苏州分行营业部

    账   户:512907942610802

 

点击了解【抽奖详情】