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培训新闻

Discovery Studio

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基于分子对接的虚拟筛选

培训主题:基于分子对接的虚拟筛选

培训时间:2013年5月15-17日,共三天

培训地点:上海创腾科技培训中心

培训简介:本课程将详细介绍如何采用基于分子对接的虚拟筛选策略来快速发现先导化合物

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  • 培训介绍
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  • 培训费用
  • 住宿交通

课程编号:NT16-LS9
课程时间:五月中旬,共三天
课程地点:创腾科技培训中心(上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室)
课程主题:  高效快速地发现潜在活性化合物——基于分子对接的虚拟筛选
课程简介:

        随着计算机在药物发现中逐渐发展成为不可缺少的手段,在计算机上利用软件进行药物虚拟筛选已成为先导化合物发现的一种经典且高效的方法。其中基于靶标结构,通过分子对接技术模拟小分子数据库与靶标分子间相互作用,从而虚拟筛选出潜在活性分子就是一种常用手段。在该过程中,小分子数据库的获取途径有多种方法,其中虚拟组合化合物库的设计与优化技术就极大地方便了科研工作者在计算机上高效且快速地构建并优化大容量化合物分子库。
        基于Discovery Studio这一分子模拟的综合平台,本课程将详细介绍如何采用基于分子对接的虚拟筛选策略来快速发现先导化合物,包括所运用的每一个模块的原理、应用及操作,帮助学员更好地掌握这一重要的模拟手段,从而应用到先导化合物发现相关工作当中。

预备知识:
参加本课程的学习需要对蛋白和小分子、药化知识有一定的了解。

课程形式:

  • 通过文献案例分析讲解基于分子对接的虚拟筛选策略,以及相应功能模块的原理介绍;
  • 上机操作练习:讲解基于分子对接的虚拟筛选过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置;|
  • 发散式教学:剖析技术细节,与实际问题相联系,解决实际问题;
  • 不定期邀请业界知名专家介绍行业研究动态,分享研究经验;
  • 学员交流与答疑,描述应用现状和解决方法。

课程内容:

  • 虚拟组合库的设计:基于反应的设计,基于公共骨架的设计,基于Breed杂交技术的设计
  • 虚拟组合库的优化:分子类药性分析,药代动力学特性及毒性分析,分子相似性和多样性分析,Pareto同时优化多种性质;
  • 快速药物虚拟筛选方法之一:基于分子对接的虚拟筛选
    --基于“热区”匹配的高通量虚拟筛选技术
    --基于形状匹配的高通量虚拟筛选技术
  • 快速药物虚拟筛选方法之二:分子类药性分析,药代动力学特性及毒性分析
  • 精确的药物作用模式预测方法:基于格点计算的精确对接技术
  • 课程结业证书:全部参加学习完本次培训课程后,可获得培训班结业证书
  • 课程资格认证考试:仅限报明参加资格认证考试的培训生

资格认证考试:

  • 本培训课程提供收费的资格认证考试(人民币800元整);
  • 该资格认考试由创腾科技联合国内知名药化企业及学术界的药物化学同行共同举行。考试合格者,将颁发资格认证书。获得资格认证的培训生,将享有优先与联合培养单位签约等权利。详情内容可参考附件1《北京创腾科技有限公司联合培养计划》。

授课及教材编写:

  • 全程授课由生命科学部门技术支持负责;
  • 教学材料包括纸版的PPT材料(含原理讲解及案例分析)和中文操作教程。
  • 培训期间会不定期邀请业内知名人士来培训班担任客座讲师。

面向对象(推荐):
没有或只有少量模拟经验的药化研究人员。

培训班联系人:
创腾科技有限公司 市场部
电话:021-58353866-242(万小姐),15121060342
                021-58353866-233(陈小姐),13916858963
传真:021- 50158556
Email:market@neotrident.com
Web:www.neotrident.com

 

日期

时间

内容

5月15日

08:30-09:00

报到和注册
培训地点:上海浦东区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室

09:00-10:15

Discovery Studio基本界面
DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与实际操作

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

虚拟筛选概述;分子对接理论介绍
药物虚筛专题之一:基于分子对接的虚拟筛选(DS_LibDock)
基本原理介绍及案例分析

11:45-13:30

午餐

13:30-14:45

药物虚筛专题之一:基于分子对接的虚拟筛选(DS_LibDock)
参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:15

药物虚筛专题之二:基于分子对接的虚拟筛选(DS_Ligandfit)
基本原理介绍及案例分析

16:15-17:15

课程讨论及答疑

5月16日

09:00-10:15

药物虚筛专题之二:基于分子对接的虚拟筛选(DS_Ligandfit)
参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:45

药物虚筛专题之三:基于公共骨架、化学反应构建虚拟组合库
基本原理介绍、案例分析、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

11:45-13:30

午餐

13:30-14:00

药物虚筛专题之四:片段数据库的产生
基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

14:00-14:45

药物虚筛专题之五:基于Breed杂交技术构建虚拟组合库
基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:15

药物虚筛专题之六:基于分子性质和结构的虚拟筛选(分子类药性分析,分子相似性和多样性分析、ADMET分析)
基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

16:15-17:15

课程讨论及答疑

5月17日

09:00-10:15

药物虚筛专题之七:精确的药物作用模式预测(DS_CDOCKER)
基本原理介绍及案例分析

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

药物虚筛专题之七:精确的药物作用模式预测(DS_CDOCKER)
参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

11:45-13:30

午餐

13:30-15:00

药物虚筛专题之八:精确的药物作用模式预测(DS_Flexible Docking)
基本原理介绍、案例分析、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:00

高效快速地发现潜在活性化合物——基于分子对接的虚拟筛选 总结
模拟思路回顾、技术点回顾、案例分析

16:00-17:00

资格认证考试(仅限报名参加资格认证考试的培训生)

 

课程费用:

培训费用

1人参加

优惠条件1:同一单位,多人参加同一门课程

优惠条件2:同一学员,一年内多次参加培训中心课程

2人以上

3人以上

第2次

第3次

学术客户

3600/人

3000/人

2700/人

3000/人

2700/人

企业客户

5400/人

4800/人

4500/人

4800/

4500/人

 

 

 

 

 

 

 

补充优惠:
   
1. 每位参加培训班的学员,如能额外推荐3名人员参加培训,则可获得免费听课券一张。(有效期限一年)可选择一年中任意一节培训班免费参加,当次课程除外。(认证考试, 需另行缴费。)

    2. 本次课程资格认证考试(800元)免费。(推广期6月份之前的培训均享受此项优惠)

付费方式:
 a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)
       户 名:北京创腾科技有限公司上海分公司
       开户行:中国工商银行上海市分行浦东开发区白杨路支行
       账 户:1001154119006907319
b、现金支付:培训现场只收取现金,不接受刷卡。

住宿推荐:
1) 宾馆名称:锦江之星(上海磁悬浮总店)
       宾馆地址:上海浦东新区白杨路260号(浦东新国际博览中心 近龙阳路)
       宾馆电话:021-51099066

2)宾馆名称:锦江之星(新国际博览中心店)
       宾馆地址:上海浦东新区芳华路37号(浦东新国际博览中心 近沪南路)
       宾馆电话:021-68920708

注:以上两个经济型酒店供学员参考。因培训地址离国际博览中心较近,遇到展览旺季,周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。 


交通:乘地铁7号线花木路站下,4号出口,出站即到。