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- 培训费用
- 住宿交通
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培训时间:2019年月12月11-13日(周三至周五)
培训地点:苏州创腾科技培训中心
主办方:北京创腾科技有限公司
► 培训主旨:
本次培训班旨在帮助学员快速了解并掌握Discovery Studio中有关酶的理性设计的各模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决并快速上机操作,能够将各模拟方法灵活应用到实际的酶领域相关研究课题中,学以致用,解决实际的应用问题。具体包括:
■ 从分子水平分析、预测并优化酶结构
■ 从分子水平预测并解释酶-底物的作用机制
■ 基于理性设计方法改造并优化酶结构
■ 分析可能的突变位点以提高酶的稳定性、同底物的亲和力等
► 培训对象:
没有或只有少量模拟研究经验,或刚开始使用Discovery Studio软件、希望进一步系统掌握软件使用技巧、能够快速上机模拟操作相关课题的酶研究领域人员。
► 培训内容:
本次培训以Discovery Studio软件的基础操作和应用为核心,以酶的理性设计为基础,针对酶的理性设计中所涉及的技术进行介绍与上机操作,包括:基于酶的一级序列预测翻译后修饰位点和酶的三维结构、酶-底物相互作用预测及优化、通过虚拟氨基酸突变设计同底物亲和力更高的酶或稳定性更高的酶、预测并引入新的二硫键提高酶的稳定性、预测酶结构表面易聚集的位点并进行突变优化、采用分子动力学分析酶的构象变化等等。
► 培训形式:
• 通过文献案例分析讲解酶理性设计策略,以及相应功能模块的原理介绍;
• 上机操作:讲解酶理性设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置(提供完整的培训教程);
• 学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。
► 课程安排:请查看上方“课程表”选项
► 网站报名:请点击此处,欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!
手机报名:识别以下二维码,手机提交报名
► 培训班联系人
创腾科技有限公司 市场部
电话:0512-67509707(转220)(叶小姐); 021-51821768转233(陈小姐),13916858963
Email:market@neotrident.com
日期 |
时间 |
内容 |
第一天
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08:30-09:00 |
报到和注册 |
09:00-10:15 |
Discovery Studio基本界面 DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与实际操作。 |
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10:15-10:30 |
茶歇 |
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10:30-11:45 |
酶的理性设计概述 酶的理性设计专题之一:酶的序列分析 酶序列的分析,如进化分析、翻译后修饰位点的预测等,应用与操作。 酶的理性设计专题之二:酶结构的构建 同源建模核心原理介绍及案例分析,同源模板的选取技巧、同源模型的优化与评价等。 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
酶的理性设计专题之二:酶结构的构建 同源建模参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-16:30 |
酶的理性设计专题之三:酶与小分子底物相互作用机理研究(CDOCKER) 分子对接的核心与原理,酶催化位点的定义,酶-底物最终作用模式的选取与分析,关键氨基酸位点的识别与显示方法,CDOCKER基本原理及案例分析。 |
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16:30-17:15 |
课程讨论及答疑 |
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第二天
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09:00-10:15 |
酶的理性设计专题之三:酶与小分子底物相互作用机理研究(CDOCKER) CDOCKER参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
10:15-10:30 |
茶歇 |
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10:30-11:45 |
酶的理性设计专题之三:酶与小分子底物相互作用机理研究(Flexible Docking) 对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking基本原理介绍、案例分析; 参数设置意义、Flexible Docking实际操作技巧及结果分析。 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-14:45 |
酶的理性设计专题之三:酶与蛋白底物相互作用机理研究(ZDOCK) 蛋白-蛋白对接,结合位点、结合模式的确定,结合表面关键残基的分析,ZDOCK基本原理介绍、案例分析,参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
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14:45-15:00 |
茶歇 |
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15:00-16:30 |
酶的理性设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(分子动力学模拟) MD基本原理,溶剂模型的添加,束缚条件的设定,平衡状态的判定等; MD参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
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16:30-17:15 |
课程讨论及答疑 |
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第三天 |
09:00-10:00 |
酶的理性设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(QM/MM) QMMM基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
10:00-10:45 |
酶的理性设计专题之四:基于亲和力进行酶设计 突变位点、突变组合的建议,原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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10:45-11:00 |
茶歇 |
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11:00-11:45 |
酶的理性设计专题之四:基于热稳定性进行酶设计 突变位点、突变组合的建议,原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
酶的理性设计专题之四:蛋白二硫键的预测与引入 二硫键位点的选取方法,实际操作技巧及结果分析。 酶的理性设计专题之四:基于蛋白聚集效应进行酶设计 建议可能的突变位点降低酶的聚集,基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-16:30 |
酶的理性设计专题之五:筛选酶的潜在底物 筛选命中率提高的方法,Libdock基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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16:30-17:15 |
课程讨论及答疑 |
培训费用 |
1人参加 |
特惠价格及条件(符合任一条件即可): 1、11月20日前成功报名并汇款; 2、同一单位,≥2人参加 ; 3、同一学员(2011年至今)曾参加过DS培训课程。 |
学术客户 |
3600/人 |
3000/人 |
企业客户 |
5400/人 |
4800/人 |
注: 1、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。
2、发票为电子发票,学员缴费后现场扫码填写发票信息,发票将发送到学员邮箱,发票内容为“培训费”或“会议费”。
3、本次培训不提供增值税专用发票,统一开增值税普通发票。
► 付费方式:
a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)
户 名:苏州创腾数据科技有限公司 (行号:308305008189)
开户行:招商银行苏州分行营业部
账 户:512907942610802
b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。
► 培训地点:苏州创腾科技培训中心
► 培训地址:
南门地址:江苏省苏州市工业园区东长路88号A2栋301室
西门地址:江苏省苏州市工业园区方中街东50米星巴克旁A2栋301室
【注:建议学员从西门进,离A2栋301室培训教室较近。】
► 培训周边住宿(请学员自行预定,费用自理):
1) 宾馆名称:桔子酒店(精选) 0512-62628333(最近)
宾馆地址:江苏省苏州市吴中区港田路南70米文化人才公寓9楼
注:本酒店为创腾学院协议酒店,预定时说明是参加创腾培训即可享受协议价格。
2) 宾馆名称:汉庭酒店(苏州凤凰新天地店) 0512-62805388
宾馆地址:苏州工业园区南榭雨街9号凤凰新天地商业二期41幢103号
3) 宾馆名称:苏州东沙湖邻里商务酒店 0512-67997868
宾馆地址:苏州工业园区东沙湖路100号
注:该酒店目前正在装修中,11月中下旬方可入住,请学员们注意。
4) 宾馆名称:宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店) 0512-81879966
宾馆地址:江苏苏州市苏州大道东292号((地铁1号线南施街站4号出口处)
注:以上四个经济型酒店供学员参考。周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。
► 园区地图参考
► 交通路线参考:
• 苏州园区火车站
1、【沪宁城铁园区站广场站】上车坐258路(星湖首末站北方向),【星湖立交南站】下车,换乘快线7号(凤凰城首末站南方向),【凤凰城首末站】下车,步行350米到。全程约1小时。
2、 打车最短距离约11公里,费用约30元。
• 苏州站
1、 地铁4号线(同里方向)【苏州火车站】上车,【乐桥站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),至【南施街站】下车1号口出,【园区城管大厦站】上快线7号路(凤凰城首末站方向),【凤凰城首末站】下车,步行350米到。全程约1小时10分钟。
2、 打车最短距离约21公里,费用约55元。
• 苏州北站
1、【京沪高铁苏州北站】乘坐快线7号(凤凰城首末站方向),【凤凰城首末站】下车,步行350米到达,全程约1小时30分钟。
2、 打车最短距离约22公里,费用约60元。