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培训时间：2019年月12月11-13日（周三至周五）
培训地点：苏州创腾科技培训中心
主办方：北京创腾科技有限公司
► 培训主旨：
本次培训班旨在帮助学员快速了解并掌握Discovery Studio中有关酶的理性设计的各模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决并快速上机操作，能够将各模拟方法灵活应用到实际的酶领域相关研究课题中，学以致用，解决实际的应用问题。具体包括：
￭ 从分子水平分析、预测并优化酶结构
￭ 从分子水平预测并解释酶-底物的作用机制
￭ 基于理性设计方法改造并优化酶结构
￭ 分析可能的突变位点以提高酶的稳定性、同底物的亲和力等
► 培训对象：
没有或只有少量模拟研究经验，或刚开始使用Discovery Studio软件、希望进一步系统掌握软件使用技巧、能够快速上机模拟操作相关课题的酶研究领域人员。
► 培训内容：
本次培训以Discovery Studio软件的基础操作和应用为核心，以酶的理性设计为基础，针对酶的理性设计中所涉及的技术进行介绍与上机操作，包括：基于酶的一级序列预测翻译后修饰位点和酶的三维结构、酶-底物相互作用预测及优化、通过虚拟氨基酸突变设计同底物亲和力更高的酶或稳定性更高的酶、预测并引入新的二硫键提高酶的稳定性、预测酶结构表面易聚集的位点并进行突变优化、采用分子动力学分析酶的构象变化等等。
► 培训形式：
• 通过文献案例分析讲解酶理性设计策略，以及相应功能模块的原理介绍；
• 上机操作：讲解酶理性设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置（提供完整的培训教程）；
• 学员交流与讨论，工程师进行现场答疑答疑。
► 课程安排：请查看上方“课程表”选项
► 网站报名：请点击此处，欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限，报名从速！
手机报名：识别以下二维码，手机提交报名
► 培训班联系人
创腾科技有限公司 市场部
电话：0512-67509707（转220）（叶小姐）； 021-51821768转233（陈小姐），13916858963
Email:market@neotrident.com
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日期 |
时间 |
内容 |
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第一天
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08:30-09:00 |
报到和注册 |
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09:00-10:15 |
Discovery Studio基本界面 DS背景介绍，DS界面介绍，蛋白与小分子的预处理方法介绍与实际操作。 |
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10:15-10:30 |
茶歇 |
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10:30-11:45 |
酶的理性设计概述 酶的理性设计专题之一：酶的序列分析 酶序列的分析，如进化分析、翻译后修饰位点的预测等，应用与操作。 酶的理性设计专题之二：酶结构的构建 同源建模核心原理介绍及案例分析，同源模板的选取技巧、同源模型的优化与评价等。 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
酶的理性设计专题之二：酶结构的构建 同源建模参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-16:30 |
酶的理性设计专题之三：酶与小分子底物相互作用机理研究(CDOCKER) 分子对接的核心与原理，酶催化位点的定义，酶-底物最终作用模式的选取与分析，关键氨基酸位点的识别与显示方法，CDOCKER基本原理及案例分析。 |
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16:30-17:15 |
课程讨论及答疑 |
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第二天
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09:00-10:15 |
酶的理性设计专题之三：酶与小分子底物相互作用机理研究(CDOCKER) CDOCKER参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
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10:15-10:30 |
茶歇 |
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10:30-11:45 |
酶的理性设计专题之三：酶与小分子底物相互作用机理研究(Flexible Docking) 对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法，Flexible Docking基本原理介绍、案例分析； 参数设置意义、Flexible Docking实际操作技巧及结果分析。 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-14:45 |
酶的理性设计专题之三：酶与蛋白底物相互作用机理研究（ZDOCK） 蛋白-蛋白对接，结合位点、结合模式的确定，结合表面关键残基的分析，ZDOCK基本原理介绍、案例分析，参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
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14:45-15:00 |
茶歇 |
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15:00-16:30 |
酶的理性设计专题之三：酶与底物相互作用机理研究(分子动力学模拟) MD基本原理，溶剂模型的添加，束缚条件的设定，平衡状态的判定等; MD参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。 |
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16:30-17:15 |
课程讨论及答疑 |
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第三天 |
09:00-10:00 |
酶的理性设计专题之三：酶与底物相互作用机理研究(QM/MM) QMMM基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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10:00-10:45 |
酶的理性设计专题之四：基于亲和力进行酶设计 突变位点、突变组合的建议，原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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10:45-11:00 |
茶歇 |
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11:00-11:45 |
酶的理性设计专题之四：基于热稳定性进行酶设计 突变位点、突变组合的建议，原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
酶的理性设计专题之四：蛋白二硫键的预测与引入 二硫键位点的选取方法，实际操作技巧及结果分析。 酶的理性设计专题之四：基于蛋白聚集效应进行酶设计 建议可能的突变位点降低酶的聚集，基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-16:30 |
酶的理性设计专题之五：筛选酶的潜在底物 筛选命中率提高的方法，Libdock基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析 |
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16:30-17:15 |
课程讨论及答疑 |
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培训费用 |
1人参加 |
特惠价格及条件（符合任一条件即可）： 1、11月20日前成功报名并汇款； 2、同一单位，≥2人参加 ； 3、同一学员（2011年至今）曾参加过DS培训课程。 |
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学术客户 |
3600/人 |
3000/人 |
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企业客户 |
5400/人 |
4800/人 |
注： 1、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。
2、发票为电子发票，学员缴费后现场扫码填写发票信息，发票将发送到学员邮箱，发票内容为“培训费”或“会议费”。
3、本次培训不提供增值税专用发票，统一开增值税普通发票。
► 付费方式：
a、银行汇款（请在汇款时务必备注参加人员姓名）
户 名：苏州创腾数据科技有限公司 （行号：308305008189）
开户行：招商银行苏州分行营业部
账 户：512907942610802
b、现金支付：培训现场可收取现金或刷卡。
► 培训地点：苏州创腾科技培训中心
► 培训地址:
南门地址：江苏省苏州市工业园区东长路88号A2栋301室
西门地址：江苏省苏州市工业园区方中街东50米星巴克旁A2栋301室
【注：建议学员从西门进，离A2栋301室培训教室较近。】
► 培训周边住宿(请学员自行预定，费用自理):
1) 宾馆名称：桔子酒店（精选） 0512-62628333（最近）
宾馆地址：江苏省苏州市吴中区港田路南70米文化人才公寓9楼
注：本酒店为创腾学院协议酒店，预定时说明是参加创腾培训即可享受协议价格。
2） 宾馆名称：汉庭酒店(苏州凤凰新天地店) 0512-62805388
宾馆地址：苏州工业园区南榭雨街9号凤凰新天地商业二期41幢103号
3） 宾馆名称：苏州东沙湖邻里商务酒店 0512-67997868
宾馆地址：苏州工业园区东沙湖路100号
注：该酒店目前正在装修中，11月中下旬方可入住，请学员们注意。
4） 宾馆名称：宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店） 0512-81879966
宾馆地址：江苏苏州市苏州大道东292号((地铁1号线南施街站4号出口处)
注：以上四个经济型酒店供学员参考。周边住宿非常紧张，提醒学员提早预定住宿。
► 园区地图参考
► 交通路线参考：
• 苏州园区火车站
1、【沪宁城铁园区站广场站】上车坐258路（星湖首末站北方向），【星湖立交南站】下车，换乘快线7号（凤凰城首末站南方向），【凤凰城首末站】下车，步行350米到。全程约1小时。
2、 打车最短距离约11公里，费用约30元。
• 苏州站
1、 地铁4号线（同里方向）【苏州火车站】上车，【乐桥站】下车换乘地铁1号线（钟南街方向），至【南施街站】下车1号口出，【园区城管大厦站】上快线7号路（凤凰城首末站方向），【凤凰城首末站】下车，步行350米到。全程约1小时10分钟。
2、 打车最短距离约21公里，费用约55元。
• 苏州北站
1、【京沪高铁苏州北站】乘坐快线7号（凤凰城首末站方向），【凤凰城首末站】下车，步行350米到达，全程约1小时30分钟。
2、 打车最短距离约22公里，费用约60元。
