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培训新闻

Discovery Studio

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4月AI时代下数据挖掘对分子筛选和设计的应用培训

培训主题:4月AI时代下数据挖掘对分子筛选和设计的应用培训

培训时间:2019年4月17-19日(共三天)

培训地点:苏州创腾科技培训中心

培训简介:(1902-LS)本次培训课程就将基于分子模拟与分子设计平台Discovery Studio和基于信息整合和流程定制平台Pipeline Pilot,针对数据挖掘的各个环节以及不同策略进行详细讲..

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  • 住宿交通

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培训时间:2019年月4月17-19日(周三至周五)

培训地点:苏州创腾科技培训中心(江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室)

关于数据挖掘,最简单的理解就是从结构化的数据库中提取有价值信息的过程。具体到药物设计领域,数据挖掘对象则主要集中在化学和生物学两方面的大数据研究和分析。面对来自各种公共数据库或者实验室内部的海量化合物数据,如何更加有效的进行化学数据的深入挖掘和分析是我们急需解决的问题之一。由于大数据的高度复杂性,药物研发人员或小分子设计人员可以借助计算机进行化学数据的挖掘分析,将这些数据快速而准确的转变成有用的医药知识和可以利用的信息,从而显著提高药物研发成功率、缩短药物研发周期以及降低药物研发成本。

本次培训课程就将基于分子模拟与分子设计平台Discovery Studio和基于信息整合和流程定制平台Pipeline Pilot,针对数据挖掘的各个环节以及不同策略进行详细讲解与演示,包括数据库的获取和处理分析、虚拟组合化学库的构建、数据的预处理、基于药物设计的多种机器学习方法、基于分子类药性和ADMET性质过滤以及PP在文献挖掘、化学信息学、统计分析和数据挖掘方面的应用等。

► 培训主旨:

本次培训班旨在帮助学员了解并掌握Discovery Studio和Pipeline Pilot中有关数据挖掘在分子筛选和设计方面的各模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题解决和上机操作。

 培训对象:

从事药物研发相关领域的科研工作者,或其他研究领域以小分子为研究对象的人员,关注数据挖掘、虚拟筛选、化学信息学和Discovery Studio/Pipeline Pilot。

► 培训内容:

本次培训课程将会介绍Discovery Studio软件中可用于分子数据挖掘的不同功能和策略,包括:数据库的获取和处理分析、虚拟组合化学库的构建、数据的预处理、基于药物设计的多种机器学习方法、基于分子类药性和ADMET性质过滤等;并对Pipeline Pilot基本内容以及其在文献挖掘、化学信息学、统计分析和数据挖掘方面的应用等做详细介绍。

► 培训形式:

• 通过文献案例分析讲解DS和PP软件在数据挖掘中的应用以及策略,以及相应功能模块的原理介绍;

• 上机操作:讲解数据挖掘策略中相应DS和PP功能模块的具体操作及参数设置(提供完整的培训教程);

• 学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。

 课程安排:请查看上方课程表”选项

► 网站报名:请点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!

    手机报名:识别以下二维码,手机提交报名

                     


► 培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:0512-67509707(转220)(叶小姐); 021-51821768转233(陈小姐),13916858963

Email:market@neotrident.com

培训网站http://training.neotrident.com/

日期

时间

内容

第一天

08:30-09:00

报到和注册

报到地点:苏州创腾培训中心

09:00-10:30

Discovery Studio基本界面

DS基本介绍、界面及基础操作

数据挖掘概述

数据挖掘在分子筛选设计中的应用及策略介绍

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

数据挖掘专题之一:大数据来源——与新药研发相关的数据库

中药化学数据库、BIOVIA数据库、常用小分子数据库、蛋白数据库以及药效团数据库的介绍及使用

12:00-13:30

午餐

13:30-15:00

数据挖掘专题之一:大数据来源——构建虚拟组合化合物库(DS Library Design)

基于公共骨架、化学反应等方法构建用户自定义化合物库;帕累托优化组合库的性质

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:30

数据挖掘专题之二:数据优化处理——化学小分子的预处理

化学结构转化、分子相似性搜索、分子建模预处理等

16:30-17:15

数据挖掘专题之三:数据挖掘在分子筛选和设计中的应用——重点案例分析

17:15-18:00

课程讨论及答疑

第二天

09:00-10:15

数据挖掘专题之四:数据挖掘中常见机器学习方法原理

主成分分析和偏最小二乘算法、贝叶斯分类算法、回归分类算法、遗传算法、人工神经网络算法等

10:15-10:30

茶歇

10:30-12:00

数据挖掘专题之四:基于药物设计的机器学习方法(DS QSAR)

多种机器学习方法构建2D-QSAR模型、案例分析、参数设置及结果分析

12:00-13:30

午餐

13:30-15:30

数据挖掘专题之四:基于药物设计的机器学习方法(DS QSAR)—续

多种机器学习方法构建2D-QSAR模型、利用小分子性状和电荷构建3D-QSAR模型、案例分析、参数设置及结果分析

15:30-15:45

茶歇

15:45-17:15

数据挖掘专题之四:机器学习方法在药物设计方面的应用——ADMET的分析

ADMET\TOPKAT基本原理介绍、案例分析、参数设置及结果分析

17:15-18:00

课程讨论及答疑

第三天

9:00-10:30

数据挖掘专题之五:Pipeline Pilot基本界面

PP基础架构,PP界面介绍,构建简单的protocol,熟悉component分类

Pipeline Pilot基础内容培训

基本数据操作与筛选,PilotScript,Subprotocol的构建,发布Protocols

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

数据挖掘专题之五:Pipeline Pilot化学文献数据挖掘

Pipeline Pilot可以在文献综述自动识别化学名称,并转换为化学结构;基于此构建的化学文献数据库,可以支持基于化学结构查询的智能化学文献检索功能。

12:00-13:30

午餐

13:30-15:30

数据挖掘专题之五:Pipeline Pilot在化学信息学中的应用

Chemistry模块概述,化合物的理化性质计算及结构处理,分子指纹,化学结构搜索;组合化合物库的设计,构效关系分析,计算最大公用子结构,生物电子等排体优化,互变异构与光学异构处理

15:30-15:45

茶歇

15:45-17:15

数据挖掘专题之五:Pipeline Pilot统计分析和数据挖掘

Pipeline Pilot的R统计分析模块;PP统计模块在图像分析、序列分析、光谱分析中的应用

17:15-18:00

课程讨论及答疑

 

注册类型

注册费用

特惠费用及条件(符合任一条件):

1、3月25日前成功报名并汇款;

2、同一单位,≥2人参加 ;

3、同一学员(2011年至今)曾参加过DS培训课程。

学术客户

3600/人

3000/人

企业客户

5400/人

4800/人

注: 1、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。

       2、发票为电子发票,学员缴费后现场扫码填写发票信息,发票将发送到学员邮箱,发票内容为“培训费”“会议费”

       3、本次培训不提供增值税专用发票,统一开增值税普通发票。

  付费方式:

    a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

         户   名:州创腾数据科技有限公司 (行号308305008189)

         开户行:招商银行苏州分行营业部

         账   户:512907942610802

    b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。

 培训地点:苏州创腾科技培训中心
►  培训地址:

南门地址:江苏省苏州市工业园区东长路88号A2栋301室

西门地址:江苏省苏州市工业园区方中街东50米星巴克旁A2栋301室

【注:建议学员从西门进,离A2栋301室培训教室较近。】

 训周边住宿(请学员自行预定,费用自理):

1)    宾馆名称:桔子酒店(精选)   0512-62628333(最近)
      宾馆地址:江苏省苏州市吴中区港田路南70米文化人才公寓9楼

注:本酒店为创腾学院协议酒店,预定时说明是参加创腾培训即可享受协议价格。

2) 宾馆名称:汉庭酒店(苏州凤凰新天地店)   0512-62805388
      宾馆地址:苏州工业园区南榭雨街9号凤凰新天地商业二期41幢103号

3) 宾馆名称:苏州东沙湖邻里商务酒店         0512-67997868
      宾馆地址:苏州工业园区东沙湖路100号

4) 宾馆名称:宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店) 0512-81879966
      宾馆地址:江苏苏州市苏州大道东292号((地铁1号线南施街站4号出口处)

注:以上四个经济型酒店供学员参考。周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。

 园区地图参考

 交通路线参考:

•  苏州园区火车站

1、【沪宁城铁园区站广场站】上车坐258路(星湖首末站北方向),【星湖立交南站】下车,换乘快线7号(凤凰城首末站南方向),【凤凰城首末站】下车,步行350米到。全程约1小时。

2、 打车最短距离约11公里,费用约30元。

•  苏州站

1、 地铁4号线(同里方向)【苏州火车站】上车,【乐桥站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),至【南施街站】下车1号口出,【园区城管大厦站】上快线7号路(凤凰城首末站方向),【凤凰城首末站】下车,步行350米到。全程约1小时10分钟。

2、 打车最短距离约21公里,费用约55元。

•  苏州北站

1、【京沪高铁苏州北站】乘坐快线7号(凤凰城首末站方向),【凤凰城首末站】下车,步行350米到达,全程约1小时30分钟。

2、 打车最短距离约22公里,费用约60元。