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培训新闻

Discovery Studio

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11月国家级继续医学教育项目(分子模拟技术在生命科学中的应用)

培训主题:11月国家级继续医学教育项目(分子模拟技术在生命科学中的应用)

培训时间:11月(具体日期待定)

培训地点:北京大学医学部

培训简介:【重要】学员可获国家级I类继续教育学分6分。本次培训由北京大学医学部主办,北京创腾科技有限公司协办,培训为期三天。

在线报名 返回课程
  • 培训介绍
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  • 培训费用
  • 住宿交通

  
   ► 主办单位:北京大学基础医学院

   ►  协办单位:北京创腾科技有限公司

    ►  培训时间:11月12-14日(共三天)

    ►  培训地点:北京大学医学部

   ►  项 目 编 号: 2018 -02 -08 -009 (国)

    ►  拟授学分类别: I 类继续教育学分

   ►  拟授学分分值:6学分

 

► 培训主旨:

随着多学科交叉理论的发展和计算机性能的提升,分子模拟技术已被应用到生命科学的各个领域,发展成为一种切实有效的手段与工具来加速科研的进程,越来越多的科研人员都已经意识到分子模拟技术的重要性并将其引入到平时的科研工作当中。由北京大学基础医学院主办 北京创腾科技有限公司协办的 分子模拟技术在生命科学中的应用培训班201811月在北京举办

本次培训旨在提高对生命科学中多种经典的分子模拟技术(同源建模、分子对接、蛋白对接、蛋白设计、药效团)的系统掌握,同时依托综合性应用于生命科学领域的Discovery Studio分子模拟平台,通过上机加深对操作流程、参数设置技巧、结果分析的理解,提升解决问题的应用能力,以辅助进行生命科学的研究,包括:新药设计、蛋白结构功能研究、抗体设计等。我们诚邀广大科研工作者报名参加,现将有关事项通知如下:
 

 培训对象:

所有对分子模拟感兴趣、希望了解分子模拟并将模拟技术应用于药物研发、蛋白结构功能研究、抗体研究、酶研究、多肽研究或环境毒理研究等领域的科研人员;所有对DS感兴趣、希望进一步系统掌握DS平台中所有经典功能的原理及应用并能够快速上机模拟操作相关课题的老师和同学等。
 

► 培训形式:

● 专业针对分子模拟进行系统培训,培训模式结合了理论授课及上机操作;

● 通过文献案例分析介绍多种经典的分子模拟技术,及相应功能模块的原理介绍;

● 通过上机操作讲解每种计算方法的具体操作流程及参数设置,进行实战演练,有利于全方位的熟悉并掌握分子模拟技术并应用于生命科学领域。
 

► 培训内容:

● Discovery Studio软件基本介绍:分子模拟概述,DS软件基本情况介绍及基础操作。

● 分子间相互作用的预测——分子对接:介绍不同分子对接方法的原理、应用和操作流程,蛋白-小分子/蛋白-蛋白(抗体-抗原)结合模式的确定、结合表面关键残基的分析方法并上机操作。

● 蛋白质(含抗体)三维结构的预测——同源建模:介绍同源建模方法的原理和操作流程,介绍蛋白建模、抗体建模的方法并上机操作。

● 蛋白亲和性、稳定性的优化——蛋白理性设计:介绍通过蛋白虚拟氨基酸突变、聚集效应预测方法进行蛋白质改造优化的原理和操作,实现抗体亲和性成熟、抗体稳定性优化等应用。

● 药效团模型的构建及应用:介绍不同药效团模型的构建方法与操作,介绍基于药效团模型的药物虚拟筛选和反向找靶并上机操作。
 

 课程安排:请查看上方“课程表”选项

► 网站报名:点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!

    手机报名:识别以下二维码,手机提交报名     
    说明:本次培训40个名额,额满截止报名。
             培训费用将在9月底发布的第二轮通知中发布,敬请关注!(有意向参加者建议先提交报名信息,工作人员会优先通知您)

 

                     
                        手机报名二维码

主办:北京大学基础医学院

协办:北京创腾科技有限公司

                                     2018年9月3日


► 培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:0512-67509707(转220)(叶小姐); 021-51821768转233(陈小姐),13916858963

Email:market@neotrident.com

培训网站http://training.neotrident.com/

 

日期

时间

培训内容

第一天

08:00-09:00

报到和注册

报到地点:另行通知

09:00-10:30

● Discovery Studio基本界面

DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与入门操作

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

 蛋白质(含抗体)三维结构的预测-同源建模MODELER

同源建模核心原理介绍,同源建模参数设置讲解、实际操作技巧及结果分析。

12:00-13:30

午餐

13:30-14:45

 蛋白质(含抗体)三维结构的预测-同源建模MODELER

抗体建模,参数设置讲解、实际操作技巧及结果分析。

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:30

 蛋白-小分子对接LibDOCK

分子对接的核心与原理,蛋白活性位点定义方法,分子对接结果的分析,最优对接构象的选取方法,LibDOCK的原理等;

LibDOCK参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

16:30-17:00

课程讨论及答疑

 

 

 

 

 

 

第二天

09:00-10:30

 蛋白-小分子对接CDOCKER

关键氨基酸的识别与显示方法,作用机理的解释手段,CDOCKER原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

 蛋白-小分子对接Flexible Docking

对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

12:00-13:30

午餐

13:30-15:00

 蛋白-蛋白(抗体-抗原)相互作用预测ZDOCK

大分子对接,蛋白-蛋白/核酸/多肽结合模式的确定,结合表面关键残基的分析,原理介绍、案例分析、参数设置、实际操作技巧及结果分析。

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:30

 蛋白设计:蛋白虚拟氨基酸突变

突变位点、突变组合的建议以提高蛋白复合物亲和力或者提高蛋白的热稳性,pH和温度等环境因素的考虑,抗体亲和力成熟,抗体稳定性优化,原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析

16:30-17:00

课程讨论及答疑

第三天

9:00-10:15

 药效团模型的构建及应用-定性药效团模型的构建HipHop

经典的基于配体的药物设计方法,训练集分子的选取依据,药效团模型的评价方法,基于药效团的药物虚筛方法。Hiphop参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

10:15-10:30

茶歇

10:30-12:00

 药效团模型的构建及应用-定量药效团模型的构建HypoGen

经典的基于配体的药物设计方法,训练集分子的选取依据,药效团模型的评价方法。HypoGen参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

12:00-13:30

午餐

13:30-14:45

 药效团模型的构建及应用-基于靶标结构的药效团模型构建SBP

SBP方法的原理、实际操作方法。

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:30

 药效团模型的构建及应用-基于受体-配体复合物的药效团模型构建CBP基于药效团模型数据库PharmaDB的反向找靶

CBP方法的原理及操作,反向找靶的策略,基于药效团反向找靶的结果分析,靶标的确认方法等。

16:30-17:00

课程讨论及答疑

 


 

 

注册类型

注册费用

特惠费用及条件(符合任一条件即可):

 

1、同一单位,≥2人参加 ;

2、同一学员(2011年至今)曾参加过DS培训课程。

学术客户

4000/人

3400/人

注: 1、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。

        2、现场报道时工作人员会跟您确认发票信息,发票内容为“培训费”

     

  付费方式:

   现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。

 
 

 培训地点:北京大学医学部

►  培训地址:北京市海淀区学院路38号

 训周边住宿:(请学员自行预定,费用自理)

1)    宾馆名称:汉庭酒店(北京中关村学院桥店)    010-82326688

       宾馆地址:北京市海淀区学院路31号6号楼

2) 宾馆名称:海友良品酒店(中关村学院桥店)   010-61196131

      宾馆地址:北京市海淀区北四环中路265号

3) 宾馆名称:牡丹宾馆      010-62025544 
      宾馆地址:北京市海淀区花园东路31号

注:以上三个经济型酒店供学员参考,请学员提早预定住宿。

 

 周边住宿地图参考

 

 交通路线参考:

• 北京南站

1、【北京南站(C南口)】上车乘坐地铁4号线大兴线(安河桥北方向),【海淀黄庄站】下车,换乘10号线(知春里方向),【西土城站(B东北口)】下车,步行444米到【学知桥北站】乘坐386路公交车(清河营公交场站方向),【学院桥东站】下车,步行100米到达,全程约1小时10分钟。

2、打车约18.6公里,全程需40分钟。

• 北京西站

1、【北京西站(A北口)】上车乘坐地铁9号线(国家图书馆方向),【国家图书馆站】下车,换乘4号线大兴线(安河桥北方向),【海淀黄庄站】下车,换乘地铁10号线(知春里方向),【西土城站(B东北口)】下车,步行425米到【学知桥北站】换乘693路公交车(育新小区方向),【北京航空航天大学站】下车,步行783米到达,全程约53分钟。

2、打车约14公里,全程需35分钟。

• 北京站

1、【北京站(D南口)】上车乘坐地铁2号线(崇文门方向),【车公庄站(B东北口)】下车,步行332米到【车公庄北站】乘坐632路公交车(五彩城公交场站方向),【北京航空航天大学站】下车,步行233米到达,全程约50分钟。

2、打车约19公里,全程需45分钟。