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培训新闻

Discovery Studio

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8月分子对接高阶特训班

培训主题:8月分子对接高阶特训班

培训时间:2017年8月22-24日,共三天

培训地点:苏州 创腾科技培训中心

培训简介:本次高级培训班,通过对经典案例思路的深入剖析和文献计算过程的重复,来介绍DS中不同分子对接算法(包括Libdock、Ligandfit、CDOCKER、Flexible Docking、ZDOCK)在药物..

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培训时间:2017年8月22-24日(周二至周四)

培训主题:分子对接高阶特训班

培训地点:苏州创腾科技培训中心(江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室)


► 培训主旨:

分子对接技术是一种有效的分析分子间相互作用的方法,对于阐明作用机理有重要的理论意义,同时还可以为新药设计与开发以及蛋白质分子改造提供指导。近年来,分子对接方法已成为计算机辅助研究领域的一项重要技术,在药物虚拟筛选、药-靶/酶-底物作用机理解释、化合物构效关系分析、药物的设计和改造、蛋白结构功能研究、蛋白质理性/半理性设计等方面得到广泛的发展,成为人们关注的热点技术。基于此,创腾科技有限公司将于苏州开设一场专题的分子对接高阶特训课程。本次培训班将从分子对接的主流应用方向作为切入点,贯穿Discovery Studio中经典的分子对接技术,探讨分子对接过程中的常见问题,深度剖析经典案例的模拟思路并且上机重复案例的计算过程,从而帮助学员对分子对接的原理、方法、参数设置技巧、结果分析以及实际应用有更为深刻的理解和体验。

 

► 培训对象:

从事药物研发、酶工程、蛋白结构功能研究相关领域的科研工作者,所有对分子对接技术及应用感兴趣、对Discovery Studio软件感兴趣的老师和同学等。

 

► 培训内容:

本次培训班主要以Discovery Studio软件为依托,通过对经典案例思路的深入剖析和文献计算过程的重复,来介绍DS中不同分子对接算法(包括Libdock、Ligandfit、CDOCKER、Flexible Docking、ZDOCK)在药物设计、蛋白设计、酶领域的应用以及应用过程中的实际操作流程和需要注意的问题。
 

► 培训形式:

1、通过文献案例的分析分享分子对接技术与实际科研工作结合应用思路;
2、不同对接方法和技术原理的讲解;
3、上机操作:分子对接过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置技巧(提供完整的培训教程);
4、经典对接案例计算过程的重复及操作;
5、模拟思路的经验共享与模拟技术点常见问题探讨。


 课程安排:请查看上方“课程表”选项

网站报名:请点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!

    手机报名:识别下面二维码,手机提交报名

                     


► 培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:021-51821768转219; 021-51821768转233(陈小姐),13916858963

Email:market@neotrident.com

培训网站http://training.neotrident.com/

日期

时间

内容

第一天

08:30-09:00

报到和注册

苏州报到地点:江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室

09:00-10:30

Discovery Studio基本界面

DS基本介绍、界面及基础操作。

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

分子对接理论:分子对接概述

分子对接原理、方法、应用、不同算法概述、打分函数概述、实现流程等

分子对接的应用方向之一:基于分子对接的药物虚拟筛选

化合物虚筛流程和策略的介绍,案例分析

12:00-13:30

午餐时间

13:30-15:00

基于热区匹配的高通量虚拟筛选模块DS Libdock

非键相互作用的分析、基于关键氨基酸的虚拟筛选结果过滤、ROC曲线分析,LibDOCK的原理、参数设置及结果分析等

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:45

分子对接的实操应用之一:基于分子对接的药物虚拟筛选

案例深度剖析和案例重复

16:45-17:30

课程讨论及答疑

第二天

09:00-10:15

分子对接的应用方向之二:基于分子对接的作用机理解释(药-靶作用机理、酶-底物作用机理)、化合物构效关系分析、酶对不同底物不同催化活性分析等

案例分析

10:15-10:30

茶歇

10:30-12:00

基于形状匹配的高通量虚拟筛选模块DS_LigandFit

基于蛋白晶体复合物重对接的验证,RMSD值计算,分子对接算法的选取方法,打分函数的选取方法, LigandFit的原理、参数设置及结果分析等。

12:00-13:30

午餐时间

13:30-15:00

全柔性的对接模块DS_Flexible Docking

对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,柔性氨基酸的选择技巧,Flexible Docking原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:45

分子对接的实操应用之二:基于分子对接的作用机理解释

案例深度剖析和案例重复

16:45-17:30

课程讨论及答疑

第三天

09:00-10:15

分子对接的应用方向之三:基于分子对接的化合物改造、蛋白理性/半理性设计

案例分析

10:15-10:30

茶歇

10:30-12:00

基于格点计算的精确分子对接模块DS_CDOCKER

关键氨基酸的识别与显示方法,作用机理的解释手段,结合自由能计算、第三方打分函数重新打分,CDOCKER原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

12:00-13:30

午餐时间

13:30-15:00

蛋白-蛋白、蛋白-多肽对接模块DS ZDOCK

大分子结合模式的确定,蛋白-蛋白对接结果的柔性优化,蛋白-蛋白对接pose的过滤,结合表面关键残基的分析

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:45

分子对接的实操应用之三:基于分子对接的蛋白改造

案例深度剖析和案例重复

16:45-17:30

课程讨论及答疑

 

培训费用:

培训费用

(1人参加)

特惠价格及条件(符合任一条件即可):

1、8月15日前成功报名并汇款

2、同一单位,≥2人参加

4500/人

3600/人

注:
1、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。
2、统一开据发票内容为“培训费”,发票将在培训期间发给学员,请务必在报到前确认好开票信息,包括:发票抬头、专票或普票、税号等内容。 

 

► 收费方式:

 a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

       户   名:北京创腾科技有限公司上海分公司

       开户行:招商银行上海晨晖支行

       账   户:121919707510501

 b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。

► 培训地点:苏州创腾科技培训中心
► 培训地址:江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室

► 周边住宿(请学员自行预定,费用自理):

1) 宾馆名称:汉庭酒店(苏州凤凰新天地店)  0512-62805388|
      宾馆地址:苏州工业园区南榭雨街9号凤凰新天地商业二期41幢103号

2) 宾馆名称:苏州东沙湖邻里商务酒店  0512-67997868
      宾馆地址:苏州工业园区东沙湖路100号

3) 宾馆名称:宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店) 0512-81879966
      宾馆地址:江苏苏州市苏州大道东292号((地铁1号线南施街站4号出口处)

注:以上三个经济型酒店供学员参考。周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。

 

► 园区地图参考:

                        地理位置                                                                    园区图片

 

► 交通路线参考:

•  苏州园区火车站
   1、【沪宁城铁园区站广场站】上车坐116路,【苏州中学园区校站】下车,步行970米到。全程约1小时10分钟。
   2、打车最短距离约11公里,费用约30元。

•  苏州站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【苏州火车站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),至【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到。全程约1小时20分钟。
   2、打车最短距离约21公里,费用约55元。

•  苏州北站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【高铁苏州北站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到;全程约1小时50分钟。
   2、打车最短距离约22公里,费用约60元。