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培训新闻

Discovery Studio

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8月DS暑期软件技术特训班(北京)【即将满额】

培训主题:8月DS暑期软件技术特训班(北京)【即将满额】

培训时间:2017年8月14-18日,共五天

培训地点:北京大学

培训简介:(1705-LS)分子模拟经过几十年的发展,不论在基础理论还是在应用方面,都取得了巨大成就,已经成为化学和生命科学等领域一种必不可少的研究手段,引起了理论和实验工作..

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点击下载【PDF盖章通知
 

培训时间:2017年8月14-18日(周一至周五)

培训主题:药物发现与生命科学分子模拟技术暑期特训班
培训地点:北京大学


► 培训主旨:

分子模拟经过几十年的发展,不论在基础理论还是在应用方面,都取得了巨大成就,已经成为化学和生命科学等领域一种必不可少的研究手段,引起了理论和实验工作者的广泛关注。Discovery Studio是当前主流的面向生命科学领域的综合性分子模拟平台,通过高质量的图形界面、经多年验证的科学算法以及集成的环境,为科研工作者提供了易用高效的药物设计与大分子模拟技术和工具。趁着暑期,创腾科技有限公司将于北京开设一场生命科学分子模拟暑期特训课程。本次培训班旨在帮助学员系统了解、掌握Discovery Studio中各种经典的分子模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分析及应用思路,并能快速进行上机操作,从而在以后的科研工作中可以灵活调用相关的模拟功能开展模拟工作,解释实验现象或者为实验提供指导。

 

培训对象:

所有对分子模拟感兴趣、希望了解分子模拟并将模拟技术应用于药物研发、蛋白结构功能研究、抗体研究、酶研究或环境毒理研究等领域的科研人员;所有对Discovery Studio软件感兴趣、希望进一步系统掌握DS软件中所有经典功能的原理及应用并能够快速上机模拟操作相关课题的老师和同学等。

 

► 培训内容:

本次培训班将会介绍Discovery Studio新版本2017R2在药物设计和计算生物学领域的每个应用技术专题,整个培训的技术专题包括:

•  蛋白序列分析、翻译后修饰位点预测

•  蛋白质三维结构预测

•  抗体结构预测(update!)

•  抗体人源化改造

•  蛋白-小分子相互作用预测

•  蛋白-蛋白(核酸/多肽)相互作用预测

•  蛋白质工程(酶/抗体的理性设计与改造)

•  分子动力学模拟

•  拉伸分子动力学模拟

•  分子力学/量子力学QM/MM模拟

•  基于靶标结构的药物设计(分子对接/片段药物设计)

•  基于小分子配体的药物设计(药效团模型/QSAR)

•  Me too/me better药物设计(化合物骨架跃迁等)

•  化合物库的虚拟筛选

•  全新药物设计

•  反向找靶/老药新用

•  组合化学及组合化物库分析

•  ADMET性质预测

•  FEP计算配体相对结合自由能(New!)

 

► 培训形式:

所有培训学员每人一台计算机,可有充分的时间对培训班的每个技术点进行软件的上机操作,我们的工程师将全程提供技术服务。培训班结束后,我们将向每一位学员颁发创腾科技有限公司的生命科学模拟软件技术认书。具体培训形式如下:

•  基础方法和技术原理的讲解

•  软件的基础操作、参数设置讲解与上机练习(提供完整的培训教程)

•  通过文献案例的分析分享该模拟技术与实际科研工作结合应用思路

•  学员交流与讨论,工程师进行现场答疑。

 课程安排:请查看上方“课程表”选项

► 网站报名:请点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!
    手机报名:识别下面二维码,手机提交报名

                     

培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:021-51821768转219; 021-51821768转233(陈小姐),13916858963

Email:market@neotrident.com

培训网站http://training.neotrident.com/

 

日期

时间

内容

第一天

08:30-09:00

报到和注册

北京大学

09:00-10:00

Discovery Studio的基本界面

10:00-12:00

基于受体的药物设计专题之一:基于“热区”匹配的高通量虚拟筛选模块:DS_LibDock

12:00-12:10

培训班合影

12:10-14:00

午餐时间(餐后可回宿舍休息或直接去教室上机,工程师13:30开始答疑)

14:00-15:00

基于受体的药物设计专题之二:基于形状匹配的高通量虚拟筛选模块:DS_LigandFit

15:00-15:10

茶歇

15:10-16:10

基于受体的药物设计专题之三:基于格点计算的精确分子对接模块:DS_CDOCKER

16:10-17:30

基于受体的药物设计专题之四:全柔性的对接模块:DS_Flexible Docking

第二天

09:00-09:15

基于受体药物设计专题总结

09:15-10:15

先导化合物优化&全新药物设计专题之一:AutoLudi

10:15-10:25

茶歇

10:25-10:55

先导化合物优化&全新药物设计专题之二:Ludi

10:55-11:55

先导化合物优化&全新药物设计专题之三:MCSS

11:55-14:00

午餐时间(餐后可回宿舍休息或直接去教室上机,工程师13:30开始答疑)

14:00-14:45

先导化合物优化&全新药物设计专题之四:Grow Scaffold

14:45-15:30

先导化合物优化&全新药物设计专题之五:Replace fragment

15:30-15:40

茶歇

15:40-17:10

先导化合物优化&全新药物设计专题之六:FEP计算配体相对结合自由能

17:10-17:30

先导化合物优化&全新药物设计的总结

第三天

09:00-10:20

药效团模型专题之一:基于配体的定性药效团模型构建(HipHop)及应用

10:20-10:30

茶歇

10:30-11:55

药效团模型专题之二:基于配体的定量药效团模型构建(HypoGen)及应用

11:55-14:00

午餐时间(餐后可回宿舍休息或直接去教室上机,工程师13:30开始答疑)

14:00-15:00

药效团模型专题之三:基于靶标结构的药效团产生及应用

15:00-15:10

茶歇

15:10-16:00

药效团模型专题之四:基于配体-受体晶体复合物的药效团产生及应用,基于药效团模型数据库的反向找靶

16:00-16:15

药效团模型专题的总结

16:15-17:30

二维/三维定量构效关系(2D-QSAR /3D QSAR)

第四天

09:00-10:15

构效关系分析(MMP)

10:15-10:25

茶歇

10:25-11:25

虚拟组合化合物库的设计与分析

11:25-11:55

药物药代及毒性预测:DS_ADMET&DS_TOPKAT

11:55-14:00

午餐时间(餐后可回宿舍休息或直接去教室上机,工程师13:30开始答疑)

14:00-14:30

蛋白质序列分析:蛋白翻译后修饰位点预测、抗原线性表位预测

14:30-15:50

蛋白质同源建模专题之一:球蛋白建模

15:50-16:00

茶歇

16:00-16:40

蛋白质同源建模专题之二:GPCR类膜蛋白建模

16:40-17:30

蛋白质同源建模专题之三:抗体建模

第五天

09:00-10:15

生物大分子间相互作用模式的预测

10:15-10:25

茶歇

10:25-11:55

分子力学、分子动力学简介及应用

11:55-14:00

午餐时间(餐后可回宿舍休息或直接去教室上机,工程师13:30开始答疑)

14:00-14:50

拉伸分子动力学简介及应用

14:50-15:40

量子力学(QM)/分子力学(MM)简介及应用

15:40-15:50

茶歇

15:50-16:40

蛋白质设计专题之一:虚拟氨基酸突变

16:40-17:00

蛋白质设计专题之二:蛋白质二硫键预测

17:00-17:30

蛋白质设计专题之三:蛋白质聚集效应预测

17:30-17:40

培训班闭幕,颁发证书

 

 

► 课程费用:

培训费用

(1人参加)

特惠价格及条件(符合任一条件即可):

1、7月30日前成功报名并汇款

2、同一单位,≥4人参加 ;

4500/人

3600/人

注:
1、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。
2、统一开据发票内容为“培训费”,发票将在培训期间发给学员,请务必在报到前确认好开票信息,包括:发票抬头、专票或普票、税号等内容。 

 

► 收费方式:

 a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

       户   名:北京创腾科技有限公司上海分公司

       开户行:招商银行上海晨晖支行

       账   户:121919707510501

 b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。

► 周边住宿(以下信息仅供参考,请学员自行预定):  

1、宾馆名称:北京资源燕园宾馆
     宾馆地址:北京市海淀区颐和园路1号(硅谷电脑城对面,海淀桥东北角,北京大学西南门) 
     宾馆电话:(010)82629988
2、宾馆名称:锦江之星酒店(中关村店)
     宾馆地址:北京市海淀区海淀大街42号(海淀桥西南角)
     宾馆电话:(010)82623688
3、宾馆名称:中国科学院北京博思园客座公寓
     宾馆地址:北京市海淀区中关村北二条7号(北四环中关村三桥向北第一个红绿灯左转200米)
     宾馆电话:010-62642816 
注:暑期房源紧张,请学员尽早预定。