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培训新闻

Discovery Studio

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3月虚拟筛选方法——如何高效快速地发现潜在活性化合物(报名截止)

培训主题:3月虚拟筛选方法——如何高效快速地发现潜在活性化合物(报名截止)

培训时间:2017年3月22日-24日,共三天

培训地点:苏州创腾科技培训中心

培训简介:3月17日前报名可参加团购活动(仅限一周),本课程针对虚拟筛选的各个环节以及不同策略进行详细讲解与演示,包括数据库的获取、数据库分子的准备、多种不同方法进行化合..

在线报名 返回课程
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  • 培训费用
  • 住宿交通

点击下载【PDF课程通知3月17日前参团,享特价优惠

尊敬的老师和同学,您好!

    创腾科技有限公司将于2017年3月22日-24日在苏州举办一期“虚拟筛选那些事——如何高效快速地发现潜在活性化合物”生命科学分子模拟培训班,共为期三天。

    针对特定的药物靶标,筛选新的活性化合物是药物科研工作者和各大制药公司奋斗的目标。随着计算机在药物发现中逐渐发展成为不可缺少的手段,在计算机上利用软件针对某靶标从化合物数据库中用虚拟筛选方法搜寻活性化合物,继而集中提取几个至几十个化合物进行药理筛选,是发现新型先导化合物结构的一种经典且高效的途径。借助计算机进行化合物的虚拟筛选,药物设计者免去了传统实验筛选带来的财力、精力、时间上的消耗,缩小了药物研发的周期和投入,提高了药物研发的效率。

    本次培训课程就将基于分子模拟与分子设计平台Discovery Studio,针对虚拟筛选的各个环节以及不同策略进行详细讲解与演示,包括数据库的获取、数据库分子的准备、多种不同方法进行化合物数据库的虚筛、虚筛结果的后处理以及基于虚筛结果进一步进行的药物设计等。

  

培训相关信息如下:

【培训时间20173月22-24日,共三天

培训地点:苏州创腾科技培训中心(江苏省苏州市工业园区东长路882.5产业园A2301室)

培训主旨

本次培训班旨在帮助学员了解虚拟筛选的流程和策略,以及基于Discovery Studio如何开展虚拟筛选工作,进而快速高效的发现先导化合物并进行先导化合物的优化,包括每一种虚筛方法的核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决和上机操作。

培训对象

从事药物研发相关领域的科研工作者,或其他研究领域以小分子为研究对象的人员,关注虚拟筛选和Discovery Studio。

培训内容

本次培训课程将会介绍Discovery Studio软件中可用于药物虚拟筛选的不同功能和策略,包括:数据库的获取和准备、基于分子对接进行虚拟筛选、基于药效团模型的虚拟筛选、基于片段设计的虚拟筛选、基于化合物结构相似性的虚拟筛选、基于分子类药性和ADMET性质的过滤、虚拟组合化合物库的构建以及基于片段生长和骨架跃迁的先导化合物优化等。

培训形式

1、通过文献案例分析讲解DS软件在药物虚拟筛选中的应用以及策略;

—2、上机操作:讲解虚拟筛选策略中相应DS功能模块的具体操作及参数设置;

—3、学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。 

培训联系人:
创腾科技有限公司 市场部
电话:021-51821768-219(崔小姐)
         021-51821768-233(陈小姐),13916858963
Email:market@neotrident.com
培训网站: http://training.neotrident.com/

 

创腾科技有限公司 生命科学部
2017年2月14日

日 期

时 间

内 容

第一天

08:30-09:00

报到和注册

报到地点:江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室

09:00-10:30

Discovery Studio基本界面

DS基本介绍、界面及基础操作

虚拟筛选概述

药物虚拟筛选的基本流程及策略介绍

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

虚拟筛选专题之一:数据库的获取和预处理——类药性分析

中药化学数据库、BIOVIA数据库、常用小分子数据库及蛋白数据库的介绍及使用,数据库的预处理,包括类药性分析、结构多样性分析等

12:00-13:30

午餐

13:30-15:00

虚拟筛选专题之二:基于分子对接的虚拟筛选(DS Libdock)

分子对接的核心与原理,蛋白活性位点定义方法,分子对接结果的分析,最优对接构象的选取方法,LibDOCK的原理、参数设置和案例分析等;

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:15

虚拟筛选专题之二:基于分子对接的虚拟筛选(DS LigandFit)

分子对接算法的选取方法,打分函数的选取方法,LigandFit的原理、参数设置技巧、实际操作技巧等。

16:15-17:15

虚拟筛选专题之三:精确的药物作用模式预测(DS CDOCKER)

CDOCKER原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

17:15-18:00

课程讨论及答疑

第二天

09:00-10:15

虚拟筛选专题之三:精确的药物作用模式预测(DS Flexible Docking)

对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

10:15-10:30

茶歇

10:30-12:00

虚拟筛选专题之四:基于药效团模型的虚拟筛选(DS HipHop)

经典的基于配体的定性药效团模型构建方法,Hiphop训练集分子的选取依据,药效团模型的评价方法,基于药效团的药物虚筛方法。

12:00-13:30

午餐

13:30-15:30

虚拟筛选专题之四:基于药效团模型的虚拟筛选(DS HypoGen)

经典的基于配体的定量药效团模型构建方法,HypoGen训练集分子的选取依据,药效团模型的评价方法,基于药效团的药物虚筛方法。

15:30-15:45

茶歇

15:45-17:15

虚拟筛选专题之四:基于药效团模型的虚拟筛选(DS SBP)

基于受体结构构建药效团模型方法的原理、实际操作方法

17:15-18:00

课程讨论及答疑

第三天

9:00-10:30

虚拟筛选专题之四:基于药效团模型的虚拟筛选(DS CBP)

基于受体-配体复合物结构构建药效团模型方法的原理及操作,

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

虚拟筛选专题之五:基于片段设计的虚拟筛选(DS LUDI)

De Novo Receptor的算法原理、参数设置和实际操作技巧。

12:00-13:30

午餐

13:30-14:15

虚拟筛选专题之六:基于分子结构相似性的虚拟筛选

以活性化合物为参照,基于结构相似性筛选化合物数据库

14:15-15:00

虚拟筛选专题之七:虚拟筛选结果后处理——ADMET的分析

ADMET\TOPKAT基本原理介绍、案例分析、参数设置及结果分析

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:00

虚拟筛选专题之八:基于虚筛结果的药物设计——虚拟组合库的构建

基于公共骨架、化学反应等方法构建用户自定义化合物库,可用于二次筛选

16:00-17:15

虚拟筛选专题之九:基于虚筛结果的药物设计——Grow Scaffold/Replace Fragment先导化合物的优化

化合物片段生长的新方法,基于电子等排体替换的化合物骨架跃迁

17:15-18:00

虚拟筛选总结

模拟思路回顾、技术点回顾、案例分析

课程讨论及答疑

 

【培训费用】

培训费用

1人参加

特惠价格及条件(符合任一条件即可):

1、3月17日前成功报名并汇款;

2、同一单位,≥2人参加 ;

3、同一学员(2011年至今)曾参加过DS培训课程。

学术客户

3600/人

3000/人

企业客户

5400/人

4800/人

注: 培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。

* 参团优惠价格:每人2200元,立省1400元,>> 查看详情

【收费方式】

 a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

       户   名:北京创腾科技有限公司上海分公司

       开户行:招商银行上海晨晖支行

       账   户:121919707510501

 b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。

培训地点:苏州创腾科技培训中心
培训地址:江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室

周边住宿(请学员自行预定,费用自理):

1) 宾馆名称:汉庭酒店(苏州凤凰新天地店)  0512-62805388|
      宾馆地址:苏州工业园区南榭雨街9号凤凰新天地商业二期41幢103号

2) 宾馆名称:苏州东沙湖邻里商务酒店  0512-67997868
      宾馆地址:苏州工业园区东沙湖路100号

3) 宾馆名称:宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店) 0512-81879966
      宾馆地址:江苏苏州市苏州大道东292号((地铁1号线南施街站4号出口处)

注:以上三个经济型酒店供学员参考。周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。

 

园区地图参考:

                        地理位置                                                                    园区图片

 

交通路线参考:

•  苏州园区火车站
   1、【沪宁城铁园区站广场站】上车坐116路,【苏州中学园区校站】下车,步行970米到。全程约1小时10分钟。
   2、打车最短距离约11公里,费用约30元。

•  苏州站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【苏州火车站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),至【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到。全程约1小时20分钟。
   2、打车最短距离约21公里,费用约55元。

•  苏州北站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【高铁苏州北站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到;全程约1小时50分钟。
   2、打车最短距离约22公里,费用约60元。