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培训新闻

Discovery Studio

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6月DS计算机辅助抗体理性设计

培训主题:6月DS计算机辅助抗体理性设计

培训时间:2016年6月1-3日,共三天

培训地点:苏州创腾科技培训中心

培训简介:本次培训班旨在为学员提供一次系统的关于抗体设计的培训,帮助学员快速了解并掌握Discovery Studio2016中有关抗体理性设计的各模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分..

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  • 住宿交通

点击下载【PDF课程通知】

尊敬的老师/同学,您好!

    创腾科技有限公司将于201661-3在苏州举办一期“计算机辅助抗体理性设计”生命科学分子模拟培训班,共为期三天。

    Discovery Studio在抗体研究领域能够为科研工作者提供从抗体序列、到结构、再到功能和功能的优化一系列完整的解决方案,具体包括:基于抗体序列自动快速分析和预测抗体三维结构(Fab区、Fv区、CDR区及全长结构),指导抗体人源化改造位点,基于结构预测抗体-抗原的作用界面和作用模式,基于抗体序列和抗体结构预测抗原表位,对抗体进行理性改造和优化,进行抗体亲和力成熟,建议可能的突变位点与突变组合以提高抗体的稳定性、同抗原的亲和力、以及减少抗体的沉聚效应等。

  

培训相关信息如下:

培训时间:2016年6月1-3日,共三天
培训地点:苏州创腾科技培训中心(江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室)

 

培训主旨:

本次培训班旨在为学员提供一次系统的关于抗体设计的培训,帮助学员快速了解并掌握Discovery Studio2016中有关抗体理性设计的各模拟技术的核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决并快速上机操作,能够将各模拟方法灵活应用到实际的抗体领域相关研究课题中,学以致用,解决实际的应用问题。

 

培训对象:

从事抗体相关研究领域的科研工作者,以及有兴趣想要借助Discovery Studio分子模拟平台来开展抗体理性设计工作的相关人员。

 

培训内容:

本次培训基于Discovery Studio2016这一生命科学综合性分子模拟平台,将详细介绍DS在抗体理性设计领域提供的一系列完美解决方案与上机操作,包括:基于序列识别抗体重链及轻链可变区、恒定区、CDR区、Gemline基因、抗原线性表位以及抗体翻译后修饰位点(如糖基化位点等),抗体结构的预测与优化,抗体人源化改造、抗体-半抗原/抗原相互作用的预测,以及抗体分子的设计与改造以增强抗体-抗原的亲和力、提高抗体本身稳定性、降低抗体分子的自聚集效应,抗体亲和力成熟等等。

 

培训形式:

●    通过文献案例分析讲解抗体理性设计策略,以及相应功能模块的原理介绍;

   上机操作:讲解抗体理性设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置(提供完整的培训教程);

   学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。

 

报名请点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限,报名从速!

培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:021-51821768-233(陈小姐),13916858963
         021-51821768-259(柳小姐),15721488751
Email:market@neotrident.com
培训网站: http://training.neotrident.com/

 

日期

时间

内容

第一天

 

08:30-09:00

报到和注册
报到地点:苏州创腾培训中心

09:00-10:30

Discovery Studio基本界面

DS背景介绍,DS界面介绍,DS入门操作,

抗体、抗原分子的预处理方法介绍与实际操作

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:45

抗体理性设计概述

抗体理性设计专题之一:抗体序列的分析(含基于序列预测抗原线性表位)

基于抗体序列识别重链、轻链恒定区和可变区、CDR区、Gemline基因、糖基化位点等,识别抗原线性表位,基本原理介绍与操作

11:45-13:30

午餐

13:30-15:00

抗体理性设计专题之二:抗体结构的预测(含人源化抗体结构预测)

抗体Fab区、Fv区、scFv及全长结构的构建,CDR区的优化,抗体人源化改造,基本原理介绍及案例分析

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:30

抗体理性设计专题之二:抗体结构的构建(含人源化抗体结构预测)

参数设置、实际操作技巧及结果分析

16:30-17:15

课程讨论及答疑

第二天

 

09:00-10:30

抗体理性设计专题之三:抗体-半抗原相互作用预测(CDocker)

抗体-半抗原结合模式的确定,关键氨基酸残基位点的分析与确定,

基本原理介绍、案例分析

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:45

抗体理性设计专题之三:抗体-半抗原相互作用预测(CDocker)

参数设置、实际操作技巧及结果分析

11:45-13:30

午餐

13:30-15:00

抗体理性设计专题之三:抗体-半抗原相互作用预测(Flexible Docking)

对接过程中蛋白柔性的考虑,基本原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:00

抗体理性设计专题之四:半抗原连接位点的确定(分子动力学模拟)

MD基本原理,溶剂模型的添加,束缚条件的设定,平衡状态的判定等,半抗原连接位点的判定。

16:00-16:45

抗体理性设计专题之四:半抗原连接位点的确定(分子动力学模拟)

参数设置、实际操作技巧及结果分析

16:45-17:15

课程讨论及答疑

第三天

09:00-09:45

抗体理性设计专题之五:抗体-抗原相互作用预测(ZDOCK

抗体、抗原结合模式的确定,结合表面关键残基的分析,原理介绍、案例分析

09:45-10:30

抗体理性设计专题之五:抗体-抗原相互作用预测(ZDOCK

参数设置、实际操作技巧及结果分析

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:45

抗体理性设计专题之六:抗体亲和力成熟

突变位点、突变组合的建议以提高抗体-抗原亲和力,pH和温度等环境因素的考虑,原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析

11:45-13:30

午餐

13:30-14:15

抗体理性设计专题之六:基于热稳定性进行抗体设计

突变位点、突变组合的建议,原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析

14:15-14:45

抗体理性设计专题之六:抗体二硫键的预测与引入

二硫键位点的引入与选取,以提高抗体结构的稳定性,实际操作及结果分析。

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:15

抗体理性设计专题之六:基于蛋白聚集效应进行抗体设计

建议可能的突变位点降低抗体沉聚并进行改造,以抗体聚集效应作为指标评价抗体模型的优劣,基本原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析

16:15-17:00

课程讨论及答疑

 

课程费用:

 

注册类型

培训费用

(1人参加)

优惠价格及条件(符合任一条件即可):

优惠条件(不可与其他优惠条件同享)

1、5月25日前成功报名并汇款;
2、同一单位,≥2人参加;
3、同一学员(2011年至今)曾参加过DS培训课程;

学术客户

3600/人

3000/人

企业客户

5400/人

4800/人

注:培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。

 

收费方式:

 a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

       户   名:北京创腾科技有限公司上海分公司

       开户行:招商银行上海晨晖支行

       账   户:121919707510501

    b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。

培训地点:苏州创腾科技培训中心
培训地址:江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室

周边住宿(请学员自行预定,费用自理):

1) 宾馆名称:汉庭酒店(苏州凤凰新天地店)  0512-62805388|
      宾馆地址:苏州工业园区南榭雨街9号凤凰新天地商业二期41幢103号

2) 宾馆名称:苏州东沙湖邻里商务酒店  0512-67997868
      宾馆地址:苏州工业园区东沙湖路100号

3) 宾馆名称:宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店) 0512-81879966
      宾馆地址:江苏苏州市苏州大道东292号((地铁1号线南施街站4号出口处)

注:以上三个经济型酒店供学员参考。周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。

 


园区地图参考:

                        地理位置                                                                    园区图片

 

交通路线参考:

•  苏州园区火车站
   1、【沪宁城铁园区站广场站】上车坐116路,【苏州中学园区校站】下车,步行970米到。全程约1小时10分钟。
   2、打车最短距离约11公里,费用约30元。

•  苏州站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【苏州火车站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),至【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到。全程约1小时20分钟。
   2、打车最短距离约21公里,费用约55元。

•  苏州北站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【高铁苏州北站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到;全程约1小时50分钟。
   2、打车最短距离约22公里,费用约60元。