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培训新闻

Discovery Studio

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5月DS2016(新版本)中药研发科学化、现代化解决方案

培训主题:5月DS2016(新版本)中药研发科学化、现代化解决方案

培训时间:2016年5月18-20日,共三天

培训地点:苏州创腾科技培训中心

培训简介:本次培训班旨在帮助学员系统了解中医药研发方面的经典模拟技术——中草药数据库的检索与提取、分子对接、片段药物设计、药效团模型、反向找靶、ADMET性质的预测、虚拟组..

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  • 住宿交通

点击下载【PDF课程通知】

尊敬的老师和同学,您好!

    创腾科技有限公司将于2016年5月18日-20日在苏州举办一期“中药研发科学化、现代化解决方案”生命科学分子模拟培训班,共为期三天。

    随着屠呦呦因其发现青蒿素的突出贡献而获得2015年诺贝尔生理学或医学奖,成为首位获得诺贝尔科学类奖项的中国科学家、首位获得诺贝尔生理医学奖的华人科学家,中药发展也迎来新的契机。如何才能挖掘出传统医学“宝库”中更多的“神药”?如何实现中药研发的科学化、现代化?这是中药研发亟待解决的问题。创腾科技,作为国内资深的生命科学信息提供商,基于中药数据库、药物设计与模拟平台Discovery Studio以及信息整合和流程定制平台Pipeline Pilot,能够为中药研发科学化、现代化提供科学的解决方案,包括中药化合物数据信息的提供、中药的虚拟筛选、中药结构的改造与优化、中药-靶标作用机理的解释、中药构效关系的分析、中药的成药性评价、中药靶向原理和有效成分的预测、以中药化合物为起始结构设计组合化合物库等方面。

 

培训相关信息如下:

培训时间:2016年5月18-20日,共三天
培训地点:苏州创腾科技培训中心(江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室)

 

培训主旨:

本次培训班旨在帮助学员系统了解中医药研发方面的经典模拟技术——中草药数据库的检索与提取、分子对接、片段药物设计、药效团模型、反向找靶、ADMET性质的预测、虚拟组合化合物库的设计,包括核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决并快速上机操作等,使学员在中药设计领域中经典模拟方法的使用方面有更为深刻地理解和提高。

 

培训对象:

从事中药研发或药物研发相关领域的科研工作者,希望了解分子模拟、对分子模拟感兴趣、想借助分子模拟技术来开展中药研究工作并能快速上机模拟操作的相关人员。

 

培训内容:

本次培训主要以Discovery Studio2016软件为依托,围绕中药设计的一些热点问题,如:中药的虚拟筛选、中药结构的改造与优化、中药-靶标作用机理的解释、中药构效关系的分析、中药的成药性评价、中药靶向原理和有效成分的预测、以中药化合物为起始结构设计组合化合物库等,对DS2016中多种分子对接算法、全面的基于片段的药物设计策略、全方位的药效团模型构建方法、基于目前市场上最全药效团模型数据库的反向找靶方法、ADMET性质的预测及类药性的分析、虚拟组合化合物库的设计等技术方法及在上述热点问题中的应用进行全面介绍与探讨。此外,本次培训也将介绍TCMD中药化学数据库的检索及应用,以及基于Pipeline Pilot开发的反向对接流程进行中药有效成分的靶标搜寻应用。

 

培训形式:

———●  通过文献案例分析讲解中药设计策略,以及相应功能模块的原理介绍;

———●  上机操作:讲解中药设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置(提供完整的培训教程);

———●  学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。

 

报名请点击此处欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名额有限,报名从速!

 

培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:021-51821768(陈小姐),13916858963

Email:market@neotrident.com
培训网站: http://training.neotrident.com/

 

 

 

日期

时间

内容

第一天

08:30-09:00

报到和注册
报到地点:苏州创腾培训中心

09:00-09:30

中药化学数据库TCMD检索及应用的介绍

检索有哪些化合物从某种指定中药药用植物中分离得到;基于结构式进行精确或子结构检索;从药理活性数据检索化合物及其对应的植物来源等;将TCMD数据导出并基于DS进行虚筛。

09:30-10:45

Discovery Studio基本界面

DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与入门操作。

10:45-11:00

茶歇

11:00-12:00

中药化合物的虚拟筛选-分子对接LibDOCK

化合物虚筛流程的介绍,分子对接的核心与原理,蛋白活性位点定义方法,分子对接结果的分析,最优对接构象的选取方法,LibDOCK的原理等。

12:00-13:30

午餐

13:30-14:30

中药化合物的虚拟筛选-分子对接LibDOCK

LibDOCK参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

14:30-14:45

茶歇

14:45-16:00

中药化合物的虚拟筛选-分子对接LigandFit

分子对接算法的选取方法,打分函数的选取方法,虚筛真阳性分子命中率的提高方法,LigandFit的原理及蛋白活性位点定义方法、参数设置技巧、实际操作技巧等。

16:00-17:15

中药-靶标作用机理研究/构效关系分析-分子对接CDOCKER

关键氨基酸的识别与显示方法,作用机理的解释手段,CDOCKER原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

17:15-18:00

课程讨论及答疑

第二天

 

09:00-10:30

中药-靶标作用机理研究/构效关系分析-分子对接Flexible Docking

对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

中药化合物的改造-基于片段的药物设计LUDI

全新药物设计方法,分子的优化与改造方法,基于LUDI的虚拟筛选,LUDI的算法原理、参数设置技巧和实际操作技巧。

12:00-13:30

午餐

13:30-15:00

中药化合物的改造-基于片段的药物设计Grow ScaffoldReplace Fragment

化合物改造的新方法,化合物电子等排体的替换方法,化合物片段生长的新方法,化合物骨架跃迁,参数设置技巧和实际操作技巧等。

15:00-15:15

茶歇

15:15-17:15

药效团模型的构建及应用-定性药效团模型的构建HipHop

经典的基于配体的药物设计方法,训练集分子的选取依据,药效团模型的评价方法,基于药效团的虚筛方法。Hiphop参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

17:15-18:00

课程讨论及答疑

第三天

09:00-10:30

药效团模型的构建及应用-定量药效团模型的构建HypoGen

经典的基于配体的药物设计方法,训练集分子的选取依据,药效团模型的评价方法,基于药效团的虚筛方法。HypoGen参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

10:30-10:45

茶歇

10:45-12:00

药效团模型的构建及应用-基于靶标结构的药效团模型构建SBP

SBP方法的原理、实际操作方法,反向找靶的策略,中药有效成分的确定策略。

12:00-13:30

午餐

13:30-14:45

药效团模型的构建及应用-基于受体-配体复合物的药效团模型构建CBP

基于药效团模型数据库PharmaDB的反向找靶

CBP方法的原理及操作,反向找靶的策略,中药有效成分的确定,基于药效团反向找靶的结果分析,基于药效团确认中药有效成分的结果分析等。

14:45-15:30

中药化合物靶向原理的预测

-基于Pipeline Pilot开发的反向对接进行反向找靶,该功能也可导入DS来使用

15:30-15:45

茶歇

15:45-16:30

中药化合物成药性评价

-ADMET性质的预测、类药性的分析

16:30-17:15

以中药化合物作为起始结构设计虚拟组合化合物库

-多种不同虚拟组合化合物库的构建与优化策略

17:15-18:00

课程讨论及答疑

 

课程费用:

注册类型

培训费用

1人参加

优惠价格及条件(符合任一条件即可)

优惠条件(不可与其他优惠条件同享):

1.5月11日前成功报名并汇款;

2. 同一单位,≥2人参加;

3. 同一学员(2011年至今)曾参加过DS培训课程;

学术客户

3600/人

3000/人

企业客户

5400/人

4800/人

注:培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。

 

收费方式:

 a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

       户   名:北京创腾科技有限公司上海分公司

       开户行:招商银行上海晨晖支行

       账   户:121919707510501

    b、现金支付:培训现场可收取现金或刷卡。

培训地点:苏州创腾科技培训中心
培训地址:江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室

周边住宿(请学员自行预定,费用自理):

1) 宾馆名称:汉庭酒店(苏州凤凰新天地店)  0512-62805388|
      宾馆地址:苏州工业园区南榭雨街9号凤凰新天地商业二期41幢103号

2) 宾馆名称:苏州东沙湖邻里商务酒店  0512-67997868
      宾馆地址:苏州工业园区东沙湖路100号

3) 宾馆名称:宜必思酒店(苏州工业园区中心酒店) 0512-81879966
      宾馆地址:江苏苏州市苏州大道东292号((地铁1号线南施街站4号出口处)

注:以上三个经济型酒店供学员参考。周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。

 


园区地图参考:

                        地理位置                                                                    园区图片

 

交通路线参考:

•  苏州园区火车站
   1、【沪宁城铁园区站广场站】上车坐116路,【苏州中学园区校站】下车,步行970米到。全程约1小时10分钟。
   2、打车最短距离约11公里,费用约30元。

•  苏州站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【苏州火车站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),至【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到。全程约1小时20分钟。
   2、打车最短距离约21公里,费用约55元。

•  苏州北站
   1、地铁2号线(宝带桥南方向)【高铁苏州北站】上车,【广济南路站】下车换乘地铁1号线(钟南街方向),【钟南街站】下车1号口出,【钟南街首末站南站】上209路,【2.5产业园站】下车,步行100米到;全程约1小时50分钟。
   2、打车最短距离约22公里,费用约60元。