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培训新闻

Discovery Studio

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分子模拟技术在酶工程与酶设计的应用培训班

培训主题:分子模拟技术在酶工程与酶设计的应用培训班

培训时间:2015年4月22-24日,共三天

培训地点:上海创腾科技培训中心

培训简介:如果您从事酶相关研究领域的研究工作,对分子模拟和Discovery Studio感兴趣,想要借助DS中的模拟技术来开展酶的理性设计相关工作,包括从分子水平分析和预测酶结构,从分..

在线报名 返回课程
  • 培训介绍
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  • 培训费用
  • 住宿交通

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尊敬的老师和同学,您好!

    创腾科技有限公司将于2015年4月22日至24日举办一期针对酶的理性设计的生命科学分子模拟培训班。本次课程的培训主题是 “分子模拟技术在酶工程与酶设计的应用——同源建模、分子对接、分子动力学、QM/MM、虚拟氨基酸突变等”,共为期三天。

    如果您从事酶相关研究领域的研究工作,对分子模拟和Discovery Studio感兴趣,想要借助DS中的模拟技术来开展酶的理性设计相关工作,包括从分子水平分析和预测酶结构,从分子水平预测并解释酶-底物的作用机制,借助计算模拟技术改造并优化酶、建议可能的突变位点以提高酶的稳定性、同底物的亲和力等工作,那么您可以参加此次的培训课程。通过本次培训课程,您可以快速掌握各模拟技术的核心原理并快速上机操作,将各模拟方法灵活应用到实际的酶领域相关研究课题中,解决实际的应用问题。

  

培训相关信息如下:

课程时间:422-24日,共三天
课程地点:创腾科技培训中心(上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室)
课程名称:酶催化机理及酶设计

 

培训内容

本次培训以Discovery Studio4.1软件的基础操作和应用为核心,以酶催化机理及理性设计为基础,针对酶催化机理及设计中所涉及的技术进行介绍与上机操作,包括:基于酶的一级序列预测翻译后修饰位点和酶的三维结构、酶-底物相互作用预测及优化、通过虚拟氨基酸突变设计同底物亲和力更高的酶或稳定性更高的酶、预测并引入新的二硫键提高酶的稳定性、预测酶结构表面易聚集的位点并进行突变优化等等。

 

培训形式

1、通过文献案例分析讲解酶理性设计策略,以及相应功能模块的原理介绍;

2、上机操作:讲解酶理性设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置(提供完整的培训教程);

3、学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。

 

培训对象

没有或只有少量模拟研究经验,或刚开始使用Discovery Studio软件、希望进一步系统掌握软件使用技巧、能够快速上机模拟操作相关课题的酶研究领域人员。

 

 

资格认证考试

本培训课程提供收费的资格认证考试。详情内容可参考附件2《北京创腾科技有限公司联合培养计划》。

 

培训班联系人

创腾科技有限公司 市场部

电话:021-58353866-219(崔小姐),13916476330
         021-58353866-233(陈小姐),13916858963
Email:
market@neotrident.com
培训网站: http://training.neotrident.com/

创腾科技有限公司 生命科学部

2015年3月3日

日期

时间

内容

422

 

08:30-09:00

报到和注册
报到地点:上海浦东区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室。

09:00-10:15

Discovery Studio基本界面

DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与实际操作。

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

酶催化机理及酶设计概述

酶催化机理及酶设计专题之一:酶的序列分析

基于酶的一级序列预测其翻译后修饰位点,应用与操作。

酶催化机理及酶设计专题之二:酶结构的构建

同源建模核心原理介绍及案例分析,同源模板的选取技巧、同源模型的优化与评价等。

11:45-13:30

午餐

13:30-15:00

酶催化机理及酶设计专题之二:酶结构的构建

同源建模参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:30

酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(CDocker)

分子对接的核心与原理,酶催化位点的定义,酶-底物最终作用模式的选取与分析,关键氨基酸位点的识别与显示方法,CDOCKER基本原理及案例分析。

16:30-17:15

课程讨论及答疑

423

 

09:00-10:30

酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(CDocker)

CDOCKER参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:45

酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(FlexDock)

对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking基本原理介绍、案例分析。

11:45-13:30

午餐

13:30-14:45

酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(FlexDock)参数设置意义、Flexible Docking实际操作技巧及结果分析

14:45-15:00

茶歇

15:00-15:45

酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(分子动力学模拟)

MD基本原理,溶剂模型的添加,束缚条件的设定,平衡状态的判定等。

15:45-16:45

酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(分子动力学模拟)

MD参数设置意义、实际操作技巧及结果分析。

16:45-17:15

课程讨论及答疑

424

09:00-10:00

酶催化机理及酶设计专题之三:酶与底物相互作用机理研究(QMMM)

QMMM基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

10:00-10:45

酶催化机理及酶设计专题之四:基于亲和力进行酶设计

突变位点、突变组合的建议,原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

10:45-11:00

茶歇

11:00-11:45

酶催化机理及酶设计专题之四:基于热稳定性进行酶设计

突变位点、突变组合的建议,原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

11:45-13:30

午餐

13:30-14:45

酶催化机理及酶设计专题之四:蛋白二硫键的预测与引入

二硫键位点的选取方法,实际操作技巧及结果分析。

酶催化机理及酶设计专题之四:基于蛋白聚集效应进行酶设计

建议可能的突变位点降低酶的聚集,基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:00

酶催化机理及酶设计专题之五:筛选酶的潜在底物

筛选命中率提高的方法,Libdock和LigandFit基本原理介绍、参数设置意义、实际操作技巧及结果分析

16:00-17:00

课程讨论及答疑

 

课程费用:

培训费用

1人参加

优惠条件1:

4月15日前成功报名并汇款

优惠条件2:

同一单位,多人参加同一门课程;

或同一学员(2011年至今)多次参加创腾科技培训课程

2人或2次以上

3人或3次以上

学术客户

3600/人

3000/人

3000/人

2700/人

企业客户

5400/人

4800/人

4800/人

4500/人

注: 1、需要认证的学员需另付考试认证费,人民币800元。

2、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。

3、统一开据发票内容为 “培训费”,发票将在培训期间发给学员,若您对发票内容有特殊要求请务必在回执中注明。

 

收费方式:

a、 银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

      户 名:北京创腾科技有限公司上海分公司

      开户行:中国工商银行上海市分行浦东开发区白杨路支行

      开户行代码:102290015418

      账 户:1001154119006907319

b、 现场缴费:培训现场可收取现金或刷卡。

 

培训地点:创腾科技培训中心

具体地址:上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室

 

周边住宿:

1) 宾馆名称:锦江之星(上海磁悬浮总店)
       宾馆地址:上海浦东新区白杨路260号(浦东新国际博览中心 近龙阳路)
       宾馆电话:021-51099066
2) 宾馆名称:锦江之星(新国际博览中心店)
       宾馆地址:上海浦东新区芳华路37号(浦东新国际博览中心 近沪南路)
       宾馆电话:021-68920708

3) 宾馆名称:汉庭酒店(上海龙阳路店)  021-61657988

       宾馆地址:上海市浦东新区龙阳路2000号(近白杨路,磁悬浮总站)
       宾馆电话: 021-61657988

注:以上三个经济型酒店供学员参考。因培训地址离国际博览中心较近,遇到展览旺季,周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。 

 

交通:乘地铁7号线花木路站下,4号出口,出站即到。

地理位置                                                                    紫竹大厦