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培训新闻

Discovery Studio

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生命科学分子模拟寒假特训班【已满额】

培训主题:生命科学分子模拟寒假特训班【已满额】

培训时间:2015年1月26-28日,共三天

培训地点:上海创腾科技培训中心

培训简介:经典模拟方法在药物虚筛、改造、药靶的搜寻以及计算生物学领域的应用—— 同源建模、分子对接、片段设计、反向找靶等

在线报名 返回课程
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>>下载PDF课程通知

      根据广大Discovery Studio用户及其他从事生命科学研究人员的要求,创腾科技有限公司将于2015年1月26日至28日举办一期生命科学分子模拟寒假特训课程。本次课程的培训主题是 “经典模拟方法在药物虚筛、改造、药靶的搜寻以及计算生物学领域的应用——同源建模、分子对接、片段设计、反向找靶”,共为期三天。

      如果您对分子模拟和Discovery Studio感兴趣,想要借助DS中经典的模拟技术辅助进行药物的虚拟筛选、药物分子的优化与改造、药物潜在靶标的搜寻,以及蛋白三维结构的预测、蛋白-小分子作用机制的解释等工作,那么您可以参加此次的培训课程。通过本次培训课程,您可以快速掌握各模拟技术的核心原理并快速上机操作,将各模拟方法灵活应用到实际的研究课题中,解决实际的应用问题。

      在本次培训课程中,我们会围绕以下几种技术方法展开介绍:同源建模、分子对接、基于片段的分子设计、反向找靶,探讨如何选取同源模板,如何进行复杂蛋白结构的建模,如何选择对接算法和打分函数,如何分析对接结果,如何分析可能的潜在靶标等问题。

 

课程时间:126-28日,共三天
课程地点:创腾科技培训中心(上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室)

 

培训内容:

      本次培训班以Discovery Studio 4.1 软件的基础操作和应用为核心,针对分子模拟中一些经典方法,如同源建模、分子对接、基于片段的分子设计、反向找靶等技术进行介绍与上机操作,完整的培训内容包括三大部分:基础方法和技术原理的讲解、软件的基础操作、该模拟技术与实际科研工作的结合(文献案例的讲解)。每位培训学员有充分的时间对培训班的每个技术点进行软件的上机操作(提供完整的培训教程),我们的工程师将全程提供技术服务

 

培训形式:

· 通过文献案例分析介绍每种设计方法的应用,及相应功能模块的原理介绍;

· 上机操作练习:讲解每种设计方法过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置;

· 学员交流与讨论,工程师进行现场答疑答疑。

 

培训对象:

没有或只有少量模拟经验的药物研究或生物大分子研究领域相关人员。

 

资格认证考试:

本培训课程提供收费的资格认证考试。详情内容可参考附件2《北京创腾科技有限公司联合培养计划》。

 

培训联系人

创腾科技有限公司市场部
联系电话:021-58353866-219;13916476330(崔小姐)

               021-58353866-233;13916858963(陈小姐)

Email:market@neotrident.com;  创腾学院网站:http://training.neotrident.com/

 

日 期

时 间

内 容

1月26日

08:30-09:00

报到和注册

报到地点:上海浦东区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室

09:00-10:15

Discovery Studio基本界面

DS背景介绍,DS界面介绍,蛋白与小分子的预处理方法介绍与入门操作

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

蛋白质三维结构的预测-同源建模MODELER

同源建模核心原理介绍,抗体建模方法、跨膜蛋白建模方法、复杂模型的构建方法,同源模板的选取技巧等。

11:45-13:30

午餐

13:30-15:00

蛋白质三维结构的预测-同源建模MODELER

同源建模参数设置讲解、实际操作技巧及结果分析。

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:30

药物的虚拟筛选-分子对接LibDOCK

药物虚筛流程的介绍,分子对接的核心与原理,蛋白活性位点定义方法,分子对接结果的分析,最优对接构象的选取方法,LibDOCK的原理等。

16:30-17:15

课程讨论及答疑

1月27日

09:00-10:30

药物的虚拟筛选-分子对接LibDOCK

LibDOCK参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

10:30-10:45

茶歇

10:45-11:45

药物的虚拟筛选-分子对接LigandFit

分子对接算法的选取方法,打分函数的选取方法,虚筛真阳性分子命中率的提高方法,LigandFit的原理及蛋白活性位点定义方法等。

11:45-13:30

午餐

13:30-14:45

药物的虚拟筛选-分子对接LigandFit

LigandFit参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。

14:45-15:00

茶歇

15:00-16:15

蛋白-小分子作用机理研究-分子对接CDOCKER

关键氨基酸的识别与显示方法,作用机理的解释手段,CDOCKER原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

16:15-17:15

课程讨论及答疑

1月28日

9:00-10:15

蛋白-小分子作用机理研究-分子对接Flexible Docking

对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法,Flexible Docking原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。

10:15-10:30

茶歇

10:30-11:45

基于片段的分子设计-LUDI

全新分子设计方法,分子的优化与改造方法,基于LUDI的虚拟筛选,LUDI的算法原理、参数设置技巧和实际操作技巧。

11:45-13:30

午餐

13:30-15:15

基于片段的分子设计-Grow Scaffold/Replace Fragment

化合物改造的新方法,化合物电子等排体的替换方法,化合物片段生长的新方法,参数设置技巧和实际操作技巧等。

15:15-15:30

茶歇

15:30-16:15

基于药效团模型数据库PharmaDB的反向找靶

反向找靶的策略,药效团模型数据库的构建,基于药效团反向找靶的结果分析,靶标的确认方法等。

16:15-17:15

课程讨论及答疑

 

 

寒假特训班费用: 3000元/人

特惠价格:

—· 学生: 2200元/人(培训现场报到时需携带学生证)

—· 教师或企业:2600元/人

特惠条件:(以下两个条件均可享受优惠价格)

—· 在1月20日前确认报名并汇款.

—· 每个单位超过2人参加(包括2人).

 

注:  1、需要认证的学员需另付考试认证费,人民币800元

2、培训费包含听课费、资料费、上机费、午餐。住宿和交通费自理。

3、统一开据发票内容为 “培训费”,发票将在培训期间发给学员,若您对发票内容有特殊要求请务必在回执中注明。

 

收费方式:

a、银行汇款(请在汇款时务必备注参加人员姓名)

      户 名:北京创腾科技有限公司上海分公司

      开户行:中国工商银行上海市分行浦东开发区白杨路支行

      开户行代码:102290015418

      账 户:1001154119006907319

b、现场缴费:培训现场可收取现金或刷卡。

 

培训地点:创腾科技培训中心

具体地址:上海浦东新区芳甸路1088号紫竹国际大厦2104室

 

周边住宿:

1) 宾馆名称:锦江之星(上海磁悬浮总店)
       宾馆地址:上海浦东新区白杨路260号(浦东新国际博览中心 近龙阳路)
       宾馆电话:021-51099066
2) 宾馆名称:锦江之星(新国际博览中心店)
       宾馆地址:上海浦东新区芳华路37号(浦东新国际博览中心 近沪南路)
       宾馆电话:021-68920708

3) 宾馆名称:汉庭酒店(上海龙阳路店)  021-61657988

       宾馆地址:上海市浦东新区龙阳路2000号(近白杨路,磁悬浮总站)
       宾馆电话: 021-61657988

注:以上三个经济型酒店供学员参考。因培训地址离国际博览中心较近,遇到展览旺季,周边住宿非常紧张,提醒学员提早预定住宿。 

 

交通:乘地铁7号线花木路站下,4号出口,出站即到。

地理位置                                                                                            紫竹大厦